RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491274.5

SDHB-208, Transcript of succinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit B, humanhuman

TSL 5

Gene SDHB, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHB-208ENST00000491274 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 ZNF318Q5VUA4 2279 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 A0A1B0GVM2 712 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 A0A1W2PQF6 199 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 A0A1W2PQJ5 194 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 C2CD4BA6NLJ0 364 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 J3QL48 77 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.312e-33■■■■■ 53.1
SDHB-208ENST00000491274 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 CLDN11O75508 207 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 ASLP04424 464 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 SERPING1P05155 500 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 RHOCP08134 193 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 HLA-EP13747 358 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 GABRG2P18507 467 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 RRM1P23921 792 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 PRKCHP24723 683 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 OR1E1P30953 314 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 ADRA1BP35368 520 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 SLC19A1P41440 591 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 ARSDP51689 593 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 CDH4P55283 916 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 ECT2LQ008S8 904 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 CREB5Q02930 508 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 SULT2A1Q06520 285 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 SPEM2Q0P670 501 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 FOXC1Q12948 553 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 PTP4A2Q12974 167 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 SLC12A1Q13621 1099 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 TCEAL1Q15170 157 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 FUT11Q495W5 492 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 PLK5Q496M5 336 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 CCDC14Q49A88 953 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 ACCSLQ4AC99 568 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 FSCBQ5H9T9 825 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 TMEM215Q68D42 235 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 WDR59Q6PJI9 974 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 MON1BQ7L1V2 547 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 STRADAQ7RTN6 431 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 C14orf80Q86SX3 495 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 CACUL1Q86Y37 369 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 APCDD1Q8J025 514 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 DEFB119Q8N690 84 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 ZNF366Q8N895 744 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 C3orf20Q8ND61 904 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 WFDC5Q8TCV5 224 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 NT5C3BQ969T7 300 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 TTC17Q96AE7 1141 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 TRIM11Q96F44 468 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 LOXL4Q96JB6 756 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 C1orf74Q96LT6 269 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 MCEEQ96PE7 176 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 GABRG3Q99928 467 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 CNPY3Q9BT09 278 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 DEF6Q9H4E7 631 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 VPS28Q9UK41 221 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 HCN2Q9UL51 889 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 PIEZO1Q92508 2521 aa6.85□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 E9PAM4 449 aa6.84□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 AP5Z1O43299 807 aa6.84□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 BNIP3LO60238 219 aa6.84□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 RTN2O75298 545 aa6.84□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 RNF8O76064 485 aa6.84□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 CNTN5O94779 1100 aa6.84□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 ENDOD1O94919 500 aa6.84□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 DNTTP04053 509 aa6.84□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 MYBL1P10243 752 aa6.84□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 GZMAP12544 262 aa6.84□□□□□ -1.31
SDHB-208ENST00000491274 PSMA2P25787 234 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms