RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 GPSM1Q86YR5 675 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 PDP2Q9P2J9 529 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 KRT8P05787 483 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 GJB1P08034 283 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ZNF23P17027 643 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 LAG3P18627 525 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CDC25CP30307 473 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CLCN5P51795 746 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ENPEPQ07075 957 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CYP2A13Q16696 494 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 FAM45BPQ6NSW5 357 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 STAG3L4Q8TBR4 150 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 FAM45AQ8TCE6 357 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 PRRG3Q9BZD7 231 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 KLHL28Q9NXS3 571 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 HPGDP15428 266 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 GRK4P32298 578 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ARL2P36404 184 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CD86P42081 329 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 NME5P56597 212 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 MREGQ8N565 214 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 OPTCQ9UBM4 332 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 FSCN2O14926 492 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 TPST1O60507 370 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 BAIAP3O94812 1187 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 RPL22P35268 128 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 PAGE2BQ5JRK9 111 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 DENND1CQ8IV53 801 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SLAIN1Q8ND83 568 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 OR52K1Q8NGK4 314 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 MAN1C1Q9NR34 630 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ABCC6O95255 1503 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 RGS14O43566 566 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 USP12O75317 370 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 TYMPP19971 482 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 TTPAP49638 278 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 AFTPHQ6ULP2 937 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 LCLAT1Q6UWP7 414 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 HIPK3Q9H422 1215 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 PRDM12Q9H4Q4 367 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 COMMD8Q9NX08 183 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 GNPTGQ9UJJ9 305 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 AP3M1Q9Y2T2 418 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 PIK3C2AO00443 1686 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 E7ENQ6 273 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 UBOX5O94941 541 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 GSNP06396 782 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 PRMT2P55345 433 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SLC25A52Q3SY17 297 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 INPP5DQ92835 1189 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 NDUFA13Q9P0J0 144 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 NDUFAF1Q9Y375 327 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CNTNAP1P78357 1384 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 MAGEA13PA6NCF6 341 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 NFKB1P19838 968 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 FNDC5Q8NAU1 212 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CXorf40AQ8TE69 158 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ATL1Q8WXF7 558 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CENPTQ96BT3 561 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 DEFB118Q96PH6 123 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 MAPRE3Q9UPY8 281 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SPTLC1O15269 473 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 TBL1XO60907 577 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 RXRGP48443 463 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ARPINQ7Z6K5 226 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CERS2Q96G23 380 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ZFYVE19Q96K21 471 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CAPN10Q9HC96 672 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 A0A088AWK7 358 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 GNRH1P01148 92 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CLK1P49759 484 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CRY1Q16526 586 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 NPNTQ6UXI9 565 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 QRFPRQ96P65 431 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CROTQ9UKG9 612 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-213ENST00000489895 CLUHO75153 1309 aa17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms