RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-210ENST00000489741 CDC6Q99741 560 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-210ENST00000489741 P2RY13Q9BPV8 354 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-210ENST00000489741 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-210ENST00000489741 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-210ENST00000489741 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-210ENST00000489741 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-210ENST00000489741 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-210ENST00000489741 PANK4Q9NVE7 773 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-210ENST00000489741 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-210ENST00000489741 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-210ENST00000489741 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-210ENST00000489741 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF40A-210ENST00000489741 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF233A6NK53 670 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 K7EQS6 105 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 TGFB1I1O43294 461 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 TACC1O75410 805 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 OLFM2O95897 454 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 IDEP14735 1019 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 HDCP19113 662 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 OPRD1P41143 372 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC7A9P82251 487 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 SHC2P98077 582 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 VSTM1Q6UX27 236 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 STK32CQ86UX6 486 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 GPD1LQ8N335 351 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CPA6Q8N4T0 437 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 KYQ8NBH2 561 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 LINC00301Q8NCQ3 95 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CD101Q93033 1021 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 ATP2A3Q93084 1043 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 HPDLQ96IR7 371 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 USP28Q96RU2 1077 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 PANK2Q9BZ23 570 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CDIP1Q9H305 208 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 DTLQ9NZJ0 730 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CDH9Q9ULB4 789 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 MTMR6Q9Y217 621 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 NME7Q9Y5B8 376 aa6.77□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 ANTXRLA6NF34 631 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 B8ZZF3 427 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 DCLK1O15075 740 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 APBB3O95704 486 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 KRT19P08727 400 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 BDNFP23560 247 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 THBS2P35442 1172 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 STAT6P42226 847 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 PPP3CCP48454 512 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 ITGA1P56199 1179 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 GPR85P60893 370 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 MYO1EQ12965 1108 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 DMC1Q14565 340 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 SURF1Q15526 300 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC6Q16204 474 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CR1LQ2VPA4 569 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 STPG1Q5TH74 334 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 RASSF3Q86WH2 238 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR49Q8IV35 697 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC65Q8IXS2 484 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 FSIP1Q8NA03 581 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 HPS3Q969F9 1004 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 MYLPFQ96A32 169 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 EXOC4Q96A65 974 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 C8orf48Q96LL4 319 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNJ15Q99712 375 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 SYT15Q9BQS2 421 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM9Q9C026 710 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 TNMDQ9H2S6 317 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms