RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	PLD5	Q8N7P1	536 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	KCTD6	Q8NC69	237 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	RAET1E	Q8TD07	263 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	TTC25	Q96NG3	672 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	SERPINB12	Q96P63	405 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	OLFM3	Q96PB7	478 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	SMO	Q99835	787 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	ZWILCH	Q9H900	591 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	USP29	Q9HBJ7	922 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	EURL	Q9NYK6	297 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	RAD54B	Q9Y620	910 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CIT	O14578	2027 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	HACD1	B0YJ81	288 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	SYN3	O14994	580 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CHAD	O15335	359 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP2C2	O75185	946 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	DGKI	O75912	1065 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM155B	O75949	473 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	OAZ2	O95190	189 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV3-25	P01717	112 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CXCL10	P02778	98 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	FYN	P06241	537 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	RBP3	P10745	1247 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	NR1D1	P20393	614 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	ACTN2	P35609	894 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CHKA	P35790	457 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	GJC1	P36383	396 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	MMP13	P45452	471 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	GYS2	P54840	703 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	ROR1	Q01973	937 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	ADIG	Q0VDE8	80 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	BFSP2	Q13515	415 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	STAT4	Q14765	748 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	GPNMB	Q14956	572 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CA9	Q16790	459 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	P3H1	Q32P28	736 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	KAZN	Q674X7	775 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	OGFOD2	Q6N063	350 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	VHLL	Q6RSH7	139 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	METTL23	Q86XA0	190 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	RFX6	Q8HWS3	928 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	FLCN	Q8NFG4	579 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CPT1B	Q92523	772 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	APBB2	Q92870	758 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	LPP	Q93052	612 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	MYLPF	Q96A32	169 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CENPT	Q96BT3	561 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	PCED1B	Q96HM7	432 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC114	Q96M63	670 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC6A18	Q96N87	628 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49

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