RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388		A0A1W2PQF6	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388		E9PAM4	449 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CLDN5	O00501	218 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CAPN9	O14815	690 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TNFSF14	O43557	240 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TIMM44	O43615	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	STX6	O43752	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CILP	O75339	1184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	KIF20A	O95235	890 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CBX7	O95931	251 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	RALA	P11233	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	HLA-E	P13747	358 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ABCG1	P45844	678 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CYP2J2	P51589	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	HK2	P52789	917 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SLC8A3	P57103	927 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FAM193A	P78312	1265 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ASIC1	P78348	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	COG7	P83436	770 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PSMD6	Q15008	389 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	LRRC14	Q15048	493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PDILT	Q8N807	584 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TNMD	Q9H2S6	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GMIP	Q9P107	970 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	UBE4B	O95155	1302 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ITPR1	Q14643	2758 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	IGF2R	P11717	2491 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GREM1	O60565	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	EXOC3	O60645	756 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GJB3	O75712	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	HPX	P02790	462 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	EPHX1	P07099	455 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	IMPDH2	P12268	514 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	JUP	P14923	745 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	BMP7	P18075	431 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	LIG3	P49916	1009 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TPMT	P51580	245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CASP5	P51878	434 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	BCAT1	P54687	386 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	C21orf59	P57076	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MAP3K7CL	P57077	242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MYL6	P60660	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GRIN1	Q05586	938 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CYP24A1	Q07973	514 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SERINC3	Q13530	473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	STK38	Q15208	465 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	HLA-B	Q31612	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FUT11	Q495W5	492 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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