RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 YJEFN3A6XGL0 299 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 AHCYL1O43865 530 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 FYNP06241 537 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 THRAP10827 490 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 ITGAXP20702 1163 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 CD68P34810 354 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 EPHX2P34913 555 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 PSEN2P49810 448 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 ERFP50548 548 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 CDC16Q13042 620 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 USP4Q13107 963 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 KLF10Q13118 480 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 ANKRD23Q86SG2 305 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 RNF169Q8NCN4 708 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 AZIN2Q96A70 460 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 MFSD3Q96ES6 412 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 SENP8Q96LD8 212 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 TEKT5Q96M29 485 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 SERPINI1Q99574 410 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 COLEC11Q9BWP8 271 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 FAM192AQ9GZU8 254 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 OXSMQ9NWU1 459 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 RAP2CQ9Y3L5 183 aa15.65■□□□□ 0.1
C9orf3-218ENST00000482056 LOC100653049A0A140TA62 436 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 E9PBE3 544 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 SLCO1B7G3V0H7 640 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 SLC22A2O15244 555 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 ADCY6O43306 1168 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 KLHL41O60662 606 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 KRT34O76011 436 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 PDE5AO76074 875 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 FESP07332 822 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 DNAJB1P25685 340 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 IRF9Q00978 393 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF33AQ06730 810 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 UGP2Q16851 508 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 ZYG11AQ6WRX3 759 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 NPWQ8N729 165 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 PYDC1Q8WXC3 89 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 GBP5Q96PP8 586 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 KLHL4Q9C0H6 718 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 TASP1Q9H6P5 420 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 CAB39LQ9H9S4 337 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 CRTAC1Q9NQ79 661 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 SLC39A10Q9ULF5 831 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 BUD23O43709 281 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 USP17L7P0C7H9 530 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 GNAT1P11488 350 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 POLD2P49005 469 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 ZBTB17Q13105 803 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 IRF5Q13568 498 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 CCNIQ14094 377 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 RAB41Q5JT25 222 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 LIPMQ5VYY2 423 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 SEL1L3Q68CR1 1132 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 C16orf89Q6UX73 402 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 NAPRTQ6XQN6 538 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 ATG14Q6ZNE5 492 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 FRMD7Q6ZUT3 714 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 ACAD11Q709F0 780 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 PHTF2Q8N3S3 785 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 ARRDC4Q8NCT1 418 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 STON2Q8WXE9 905 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 RNF34Q969K3 372 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 SCYL1Q96KG9 808 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 GPR22Q99680 433 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 SMOQ99835 787 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 RHOJQ9H4E5 214 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 CHRAC1Q9NRG0 131 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 VTI1BQ9UEU0 232 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 OR12D3Q9UGF7 316 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 BCAP29Q9UHQ4 241 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 CDH9Q9ULB4 789 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 POMPQ9Y244 141 aa15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 SHROOM3Q8TF72 1996 aa15.63■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 PTGESO14684 152 aa15.63■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 HDAC3O15379 428 aa15.63■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 TREHO43280 583 aa15.63■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 CABYRO75952 493 aa15.63■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 LYNP07948 512 aa15.63■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 COL6A2P12110 1019 aa15.63■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 CXCR3P49682 368 aa15.63■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 NUMBP49757 651 aa15.63■□□□□ 0.09
C9orf3-218ENST00000482056 CPT1AP50416 773 aa15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms