RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 VAV1P15498 845 aa21.3■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 MIPP30301 263 aa21.3■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 OXTRP30559 389 aa21.3■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 ETFBP38117 255 aa21.3■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 PTGER3P43115 390 aa21.3■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 GALCP54803 685 aa21.3■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 DEFB119Q8N690 84 aa21.3■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa21.3■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 ATP11CQ8NB49 1132 aa21.3■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.3■■□□□ 1
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NELFE-208ENST00000481121 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa21.3■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 CEP250Q9BV73 2442 aa21.3■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 GON4LQ3T8J9 2241 aa21.3■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 SRCP12931 536 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 TPI1P60174 286 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 LMNB2Q03252 620 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 SEMA3BQ13214 749 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 ACAP1Q15027 740 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 CST6Q15828 149 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 PLA2G2CQ5R387 149 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 ERMARDQ5T6L9 678 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 IL31Q6EBC2 164 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 PRR23CQ6ZRP0 262 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 FAM124AQ86V42 546 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 GAS2L3Q86XJ1 694 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 FRS2Q8WU20 508 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 HSPA12BQ96MM6 686 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 CHP1Q99653 195 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
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NELFE-208ENST00000481121 VPS45Q9NRW7 570 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 SCML1Q9UN30 329 aa21.29■■□□□ 1
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NELFE-208ENST00000481121 GLDCP23378 1020 aa21.29■■□□□ 1
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NELFE-208ENST00000481121 ZNF33AQ06730 810 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 DLG2Q15700 870 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 RETSATQ6NUM9 610 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 LINGO4Q6UY18 593 aa21.29■■□□□ 1
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NELFE-208ENST00000481121 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
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NELFE-208ENST00000481121 PCK1P35558 622 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 ACVRL1P37023 503 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 PSMD8P48556 350 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 CLCN6P51797 869 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 ZNF75DP51815 510 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 CA9Q16790 459 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
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NELFE-208ENST00000481121 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 OR8D1Q8WZ84 308 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 CCDC114Q96M63 670 aa21.28■■□□□ 1
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NELFE-208ENST00000481121 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 SMOC1Q9H4F8 434 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 MID1O15344 667 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 BNIP3LO60238 219 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 ADH1BP00325 375 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 H2AFZP0C0S5 128 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 ITPKAP23677 461 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 DPP6P42658 865 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 ARF5P84085 180 aa21.27■■□□□ 1
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NELFE-208ENST00000481121 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 H2AFVQ71UI9 128 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 NIPA2Q8N8Q9 360 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 GANCQ8TET4 914 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 FOXJ1Q92949 421 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 BTBD6Q96KE9 485 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-208ENST00000481121 PACSIN1Q9BY11 444 aa21.27■■□□□ 1
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