RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 GANQ9H2C0 597 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 ANLNQ9NQW6 1124 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 OR51B4Q9Y5P0 310 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM131Q92545 1883 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 H0Y8X5 98 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 I6L893 689 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 KCNK3O14649 394 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 VILLO15195 856 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 CNTN5O94779 1100 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 DRD3P35462 400 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 FLT3P36888 993 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF75DP51815 510 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 NOMO3P69849 1222 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 KRT83P78385 493 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 KRT31Q15323 416 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 DLG2Q15700 870 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 ALFQ53S48 1182 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 HS1BP3Q53T59 392 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 KCNT1Q5JUK3 1230 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 CDKAL1Q5VV42 579 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 FAM46CQ5VWP2 391 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 NAA35Q5VZE5 725 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 LRRC31Q6UY01 552 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 DBX2Q6ZNG2 339 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 Q6ZVU0 165 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF677Q86XU0 584 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 SH2D3CQ8N5H7 860 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 PNPLA1Q8N8W4 532 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 CPA5Q8WXQ8 436 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 EBF2Q9HAK2 575 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-218ENST00000479554 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TBC1D3EA0A087X179 549 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 ALOX15BO15296 676 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 BNIP3LO60238 219 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 DFNA5O60443 496 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 GFPT2O94808 682 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF18P17022 549 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 CD38P28907 300 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 GRK6P43250 576 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 METAP1P53582 386 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 IL9RQ01113 521 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 INAVAQ3KP66 663 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 FKBP15Q5T1M5 1219 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC114Q96M63 670 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 SARDHQ9UL12 918 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 BTBD3Q9Y2F9 522 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 FAM221BA6H8Z2 402 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 C10orf142B7Z368 130 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 E9PAM4 449 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 PLK4O00444 970 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 MCF2LO15068 1137 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 SLC7A4O43246 635 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 PCDHGA12O60330 932 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 SNAP91O60641 907 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 RTN2O75298 545 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 SRCP12931 536 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 CDC25BP30305 580 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 KLK7P49862 253 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 PPP2CBP62714 309 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 PPP2CAP67775 309 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 CDR2Q01850 454 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 POM121L1PQ3SYA9 428 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 TRNP1Q6NT89 227 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4B-218ENST00000479554 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms