RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	CEP76	Q8TAP6	659 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CNPY3	Q9BT09	278 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	VPS51	Q9UID3	782 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PQJ5	194 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	FAM72C	H0Y354	149 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	15.17	■□□□□ 0.02	4e-21	■■■□□ 17.7
SSR4-208	ENST00000471880	RTN2	O75298	545 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ENG	P17813	658 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	GLDC	P23378	1020 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PRKCI	P41743	596 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ZBED6	P86452	979 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	FIGN	Q5HY92	759 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	BNIPL	Q7Z465	357 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	FAM72B	Q86X60	149 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PTPRN2	Q92932	1015 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ALG14	Q96F25	216 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM11	Q96F44	468 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC114	Q96M63	670 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SYT11	Q9BT88	431 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SCML1	Q9UN30	329 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	15.17	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ILVBL	A1L0T0	632 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880		K7ERQ8	282 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	RNF8	O76064	485 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	LRIG2	O94898	1065 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ADH1B	P00325	375 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	MT-CO1	P00395	513 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SERPING1	P05155	500 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	TPM1	P09493	284 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SRC	P12931	536 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	RHOQ	P17081	205 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	EPHB2	P29323	1055 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CASP14	P31944	242 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	OGDH	Q02218	1023 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	GNA12	Q03113	381 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	MAMLD1	Q13495	774 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	IQCD	Q96DY2	449 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PSMB7	Q99436	277 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	EPAS1	Q99814	870 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SGK2	Q9HBY8	427 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM131	Q92545	1883 aa		15.16	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		15.15	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		15.15	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC72	A6NJI9	287 aa		15.15	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	METTL12	A8MUP2	240 aa		15.15	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		15.15	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PLK4	O00444	970 aa		15.15	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	GYPC	P04921	128 aa		15.15	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINF2	P08697	491 aa		15.15	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	GZMA	P12544	262 aa		15.15	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	C5AR1	P21730	350 aa		15.15	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	HOXD12	P35452	270 aa		15.15	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	ACVRL1	P37023	503 aa		15.15	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PBX1	P40424	430 aa		15.15	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PPM1J	Q5JR12	505 aa		15.15	■□□□□ 0.02
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		15.15	■□□□□ 0.02

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