RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 ARRDC3Q96B67 414 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 ZPBPQ9BS86 351 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 ACAD9Q9H845 621 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM248Q9NWD8 314 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 TSPOAP1O95153 1857 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 EFCAB8A8MWE9 144 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 I6L893 689 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 CSTBP04080 98 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 NGFRP08138 427 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 CDC25AP30304 524 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC16A2P36021 539 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 PCP4P48539 62 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 PGGT1BP53609 377 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 PRKAA2P54646 552 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 TRIM14Q14142 442 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 TIGD6Q17RP2 521 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 KLHL22Q53GT1 634 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 Q5PR19 223 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM217AQ8IXS0 508 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 SPICE1Q8N0Z3 855 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 KDM1BQ8NB78 822 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 MIB2Q96AX9 1013 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 CLPBQ9H078 707 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 TASP1Q9H6P5 420 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC25A13Q9UJS0 675 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 LTBP4Q8N2S1 1624 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A0A0MQY5 61 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A1B0GVT2 93 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 LACTBL1A8MY62 500 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 INAFM1C9JVW0 142 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 H0Y3Z8 333 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 PKMP14618 531 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 TNFRSF8P28908 595 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 AVPR2P30518 371 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 STAT1P42224 750 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 PKP1Q13835 747 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 DCTN1Q14203 1278 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 BRD3Q15059 726 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR162Q16538 588 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC38Q502W7 563 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 AAGABQ6PD74 315 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC174Q6PII3 467 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 TRILQ7L0X0 811 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 SYT13Q7L8C5 426 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 CPT1BQ92523 772 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 NEUROG1Q92886 237 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 NPAS1Q99742 590 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 TRIM31Q9BZY9 425 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 HIPK3Q9H422 1215 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC22A11Q9NSA0 550 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 PCDHA7Q9UN72 937 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 HMX3A6NHT5 357 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 KRT38O76015 456 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 CYP1A2P05177 515 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 LCKP06239 509 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 ACP5P13686 325 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 HSPA1LP34931 641 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 RFX2P48378 723 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 CDK7P50613 346 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 CYP2J2P51589 502 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 PMS2P54278 862 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 SELENOVP59797 346 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR18Q14330 331 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 TBRG1Q3YBR2 411 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM171A1Q5VUB5 890 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM71Q6P5X7 295 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 SCN4BQ8IWT1 228 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 PIGSQ96S52 555 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 B3GNT4Q9C0J1 378 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 RMI1Q9H9A7 625 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 PLEKHA2Q9HB19 425 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 PLAC1Q9HBJ0 212 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 KLQ9UEF7 1012 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 PTPRTO14522 1441 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-206ENST00000467748 SPTLC2O15270 562 aa4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms