RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	DNTT	P04053	509 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	TCF4	P15884	667 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	GLDC	P23378	1020 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	GJC1	P36383	396 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ACVRL1	P37023	503 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ETFB	P38117	255 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	MAGEA1	P43355	309 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ID4	P47928	161 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	SPA17	Q15506	151 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	DLG2	Q15700	870 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	PLK5	Q496M5	336 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	BOLA3	Q53S33	107 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	DEFB119	Q8N690	84 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	GANC	Q8TET4	914 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	CD93	Q9NPY3	652 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	NEU3	Q9UQ49	428 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	NUMA1	Q14980	2115 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	MT-CO1	P00395	513 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	VAV1	P15498	845 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	GOT1	P17174	413 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	IL1R2	P27930	398 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	CDC25B	P30305	580 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	HTR7	P34969	479 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	SEMA3B	Q13214	749 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	MESD	Q14696	234 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	FAM124A	Q86V42	546 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	STK40	Q8N2I9	435 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	PTPRN2	Q92932	1015 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	MAGEH1	Q9H213	219 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	DONSON	Q9NYP3	566 aa		18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902		H3BRJ5	948 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902		K7ERQ8	282 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ATP9B	O43861	1147 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	PROSC	O94903	275 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	RARA	P10276	462 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	SRC	P12931	536 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	TGM1	P22735	817 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ARL4A	P40617	200 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	TPMT	P51580	245 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	KRT81	Q14533	505 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	RFX8	Q6ZV50	586 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902		Q6ZVU0	165 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	INTU	Q9ULD6	942 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		18.15	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	CEP250	Q9BV73	2442 aa		18.14	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		18.14	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	IL1B	P01584	269 aa		18.14	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	RET	P07949	1114 aa		18.14	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	CD6	P30203	668 aa		18.14	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	PSMD8	P48556	350 aa		18.14	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	DNA2	P51530	1060 aa		18.14	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	CREB5	Q02930	508 aa		18.14	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	PMS2CL	Q68D20	193 aa		18.14	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		18.14	■□□□□ 0.49

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