RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 MFN1Q8IWA4 741 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 UBALD2Q8IYN6 164 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC35F6Q8N357 371 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 NETO2Q8NC67 525 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ALG3Q92685 438 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ALS2CR12Q96Q35 445 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CALN1Q9BXU9 219 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ZYG11BQ9C0D3 744 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 DNAI1Q9UI46 699 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 TECTAO75443 2155 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1B0GVM2 712 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC66A2RUB6 948 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 SHISA7A6NL88 538 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 KIF5CO60282 957 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 CLDN11O75508 207 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 ERCC2P18074 760 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 MX2P20592 715 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 OR1E1P30953 314 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 HOXC13P31276 330 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 CD70P32970 193 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 ARL4AP40617 200 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 HCAR3P49019 387 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 DGKGP49619 791 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 EPHA4P54764 986 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 CDH4P55283 916 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 FOXK2Q01167 660 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 LMAN2Q12907 356 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 DPYSQ14117 519 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 MPP7Q5T2T1 576 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 AADACL2Q6P093 401 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 MFSD7Q6UXD7 560 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 CHST9Q7L1S5 443 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 NLRP14Q86W24 1093 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 MAP7D3Q8IWC1 876 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 KATNAL2Q8IYT4 538 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 RCOR2Q8IZ40 523 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 SIX5Q8N196 739 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 SVOPQ8N4V2 548 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM58Q8NG06 486 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 OR52K2Q8NGK3 314 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 FIBINQ8TAL6 211 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM71BQ8TC56 605 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM3CQ92520 227 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 HES6Q96HZ4 224 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 CSPG4P5Q96PW8 444 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 PNKPQ96T60 521 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 KCND1Q9NSA2 647 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 ABCB8Q9NUT2 735 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 ETNK2Q9NVF9 386 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 WNT16Q9UBV4 365 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXO10Q9UK96 956 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 ANTXRLA6NF34 631 aa8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 WASH4PA8MWX3 477 aa8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 ENC1O14682 589 aa8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 DCLK1O15075 740 aa8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 DCXO43602 365 aa8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 KAT7O95251 611 aa8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 APODP05090 189 aa8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 RHOCP08134 193 aa8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 PYGMP11217 842 aa8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 KRT10P13645 584 aa8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 GLULP15104 373 aa8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-208ENST00000463533 HLA-FP30511 346 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms