RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443090.1

GCSHP5-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 5, humanhuman

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Gene GCSHP5, Length 522 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP5-201ENST00000443090 RNF34Q969K3 372 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 VANGL2Q9ULK5 521 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 MAGEC1O60732 1142 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 CLDN11O75508 207 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 GRAP2O75791 330 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 SLC9A1P19634 815 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 TAS2R38P59533 333 aa20.43■□□□□ 0.86
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GCSHP5-201ENST00000443090 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 ACCSLQ4AC99 568 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 C14orf80Q86SX3 495 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 NRSN2Q9GZP1 204 aa20.43■□□□□ 0.86
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GCSHP5-201ENST00000443090 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 VPS28Q9UK41 221 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PAGE1O75459 146 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 DAB1O75553 588 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 CKMT2P17540 419 aa20.42■□□□□ 0.86
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GCSHP5-201ENST00000443090 USP8P40818 1118 aa20.42■□□□□ 0.86
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GCSHP5-201ENST00000443090 RTP5Q14D33 572 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PROX2Q3B8N5 592 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PASD1Q8IV76 773 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 TMEM145Q8NBT3 493 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 RFFLQ8WZ73 363 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 DCBLD2Q96PD2 775 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 ERBB2P04626 1255 aa20.41■□□□□ 0.86
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GCSHP5-201ENST00000443090 CDH4P55283 916 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 NME3Q13232 169 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 STAT4Q14765 748 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 OR6B2Q6IFH4 312 aa20.41■□□□□ 0.86
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GCSHP5-201ENST00000443090 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 NOX5Q96PH1 765 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PSMB7Q99436 277 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 CA5BQ9Y2D0 317 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 MT-CO1P00395 513 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 CTSLP07711 333 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 ACP1P24666 158 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 NOS2P35228 1153 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 SLC6A3Q01959 620 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF683Q8IZ20 524 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PIGVQ9NUD9 493 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
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GCSHP5-201ENST00000443090 SDC3O75056 442 aa20.39■□□□□ 0.85
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GCSHP5-201ENST00000443090 CNTN5O94779 1100 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF18P17022 549 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP5-201ENST00000443090 PON1P27169 355 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP5-201ENST00000443090 ITPKBP27987 946 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP5-201ENST00000443090 SEMG2Q02383 582 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP5-201ENST00000443090 ALFQ53S48 1182 aa20.39■□□□□ 0.85
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GCSHP5-201ENST00000443090 SLC25A45Q8N413 288 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP5-201ENST00000443090 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.39■□□□□ 0.85
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GCSHP5-201ENST00000443090 NPY6RQ99463 290 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP5-201ENST00000443090 MUC3BQ9H195 1237 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP5-201ENST00000443090 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP5-201ENST00000443090 RRN3Q9NYV6 651 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP5-201ENST00000443090 VPS51Q9UID3 782 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP5-201ENST00000443090 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP5-201ENST00000443090 CFAP46Q8IYW2 2715 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP5-201ENST00000443090 MGAQ8IWI9 3026 aa20.38■□□□□ 0.85
GCSHP5-201ENST00000443090 SIGLEC6O43699 453 aa20.38■□□□□ 0.85
GCSHP5-201ENST00000443090 SNAP91O60641 907 aa20.38■□□□□ 0.85
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