RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426541.1

RBSN-202, Transcript of rabenosyn, RAB effector, humanhuman

TSL 3

Gene RBSN, Length 664 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBSN-202ENST00000426541 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 SNTG2Q9NY99 539 aa5.96□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa5.96□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 SERPINB13Q9UIV8 391 aa5.96□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 STK38LQ9Y2H1 464 aa5.96□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 GIT1Q9Y2X7 761 aa5.96□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 TTLL3Q9Y4R7 772 aa5.96□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 LRRC37A2A6NM11 1700 aa5.96□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 CHD9Q3L8U1 2897 aa5.96□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 MACROD2A1Z1Q3 448 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 HTR3EA5X5Y0 456 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 FAM221BA6H8Z2 402 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 GOLGA8BA8MQT2 603 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 CAPN14A8MX76 684 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 E7EWF7 191 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 F8W8V4 182 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 GOLGA8TH3BQL2 631 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 DCXO43602 365 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 AKR1B10O60218 316 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 ATP9AO75110 1047 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 PEX11AO75192 247 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 ASMTLO95671 621 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 CD4P01730 458 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 PFKMP08237 780 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 C1SP09871 688 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 GOLGA8HP0CJ92 632 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 STIP1P31948 543 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 HOXD12P35452 270 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 MAGEA1P43355 309 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 GUCY2FP51841 1108 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 PMS2P54278 862 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 IRF9Q00978 393 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 HGFACQ04756 655 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 TFCP2Q12800 502 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 STRN3Q13033 797 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 CNGA3Q16281 694 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 ZCWPW2Q504Y3 356 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 TM4SF20Q53R12 229 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 TRIM61Q5EBN2 209 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 MFSD4BQ5TF39 518 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 RNF220Q5VTB9 566 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 FOXR2Q6PJQ5 311 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 LRRC34Q8IZ02 419 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 NUP93Q8N1F7 819 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 KBTBD3Q8NAB2 608 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 DDI1Q8WTU0 396 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 NAT14Q8WUY8 206 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 CASP10Q92851 521 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 TCEANC2Q96MN5 208 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 FMO2Q99518 471 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 NACA2Q9H009 215 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 DPH5Q9H2P9 285 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 Q9H521 79 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 TMEM165Q9HC07 324 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 FAIMQ9NVQ4 179 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 CARD8Q9Y2G2 431 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 VWA7Q9Y334 891 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 UMODL1Q5DID0 1318 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 XIRP2A4UGR9 3374 aa5.95□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 MYO9BQ13459 2157 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 NID2Q14112 1375 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 A0A1W2PRG0 241 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 ZNF185O15231 689 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 CCDC22O60826 627 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 TPPPO94811 219 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 ESRRBO95718 433 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 IL9P15248 144 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 ZNF12P17014 697 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 PTPN4P29074 926 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 GUCY1A2P33402 732 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 PHBP35232 272 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 COPB2P35606 906 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 LIFRP42702 1097 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 MCAMP43121 646 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 KIF11P52732 1056 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 SLC18A1P54219 525 aa5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RBSN-202ENST00000426541 BPIFB4P59827 614 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms