RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TK2O00142 265 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THAP12O43422 761 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1QL1O75973 258 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AFPP02771 609 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLDCP23378 1020 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCR1P32246 355 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDK17Q00537 523 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C19orf57Q0VDD7 668 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DLG2Q15700 870 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POM121L1PQ3SYA9 428 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACCSLQ4AC99 568 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXR2Q6PJQ5 311 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZVU0 165 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFB106AQ8N104 65 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NELFBQ8WX92 580 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALG14Q96F25 216 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC2A13Q96QE2 648 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PREBQ9HCU5 417 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDIT4Q9NX09 232 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX16Q9P0S2 106 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAN1B1Q9UKM7 699 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CA5BQ9Y2D0 317 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAI2Q9Y5P3 530 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BICDL2A1A5D9 508 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM38O00635 465 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCF2LO15068 1137 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIGLEC6O43699 453 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNA14O95837 355 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF18P17022 549 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACTN2P35609 894 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRAK1P51617 712 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH2D3CQ8N5H7 860 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM145Q8NBT3 493 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52K2Q8NGK3 314 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGF11Q92914 225 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF34Q969K3 372 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHDC7BQ96G42 594 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FEM1AQ9BSK4 669 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACP6Q9NPH0 428 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASNSD1Q9NWL6 643 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS28Q9UK41 221 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VANGL2Q9ULK5 521 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTNND2Q9UQB3 1225 aa13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BNIP3LO60238 219 aa13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSF2BPO75031 334 aa13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLI1P08151 1106 aa13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THEGLP0DJG4 465 aa13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GGCXP38435 758 aa13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MARSP56192 900 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAS2R38P59533 333 aa13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DAB2P98082 770 aa13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E2F1Q01094 437 aa13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTA1Q13330 715 aa13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AUHQ13825 339 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D25Q3MII6 688 aa13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A45Q8N413 288 aa13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4C6Q8NH72 309 aa13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYOCQ99972 504 aa13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR51B4Q9Y5P0 310 aa13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HS3ST4Q9Y661 456 aa13.52□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLDN11O75508 207 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MT-CO3P00414 261 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTSLP07711 333 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRCP12931 536 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRLRP16471 622 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BMP6P22004 513 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DGKAP23743 735 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TLE3Q04726 772 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC173Q0VFZ6 552 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HS1BP3Q53T59 392 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFHC1Q5JVL4 640 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDM7AQ6ZMT4 941 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR155Q7Z3F1 870 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERICH1Q86X53 443 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPXM1Q96SM3 734 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MUC3BQ9H195 1237 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HS3ST2Q9Y278 367 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa13.51□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PQU0 124 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC31A1O15431 190 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FFAR2O15552 330 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRAP2O75791 330 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDH4P55283 916 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STX17P56962 302 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNMA1Q12791 1236 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NME3Q13232 169 aa13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms