RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 SPATA20Q8TB22 786 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 STK32AQ8WU08 396 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 OR8D1Q8WZ84 308 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 KLK6Q92876 244 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 NT5C1BQ96P26 610 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ASCL3Q9NQ33 180 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 BSNQ9UPA5 3926 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 FLNCQ14315 2725 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 PTPN13Q12923 2485 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 SLC31A1O15431 190 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 PIAS2O75928 621 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 APOEP02649 317 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 THEGLP0DJG4 465 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 PRLRP16471 622 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 LSSP48449 732 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 FAM46CQ5VWP2 391 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 Q6ZVU0 165 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 TMC6Q7Z403 805 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 OR13H1Q8NG92 308 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 TTC9Q92623 222 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ARRDC3Q96B67 414 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 LGMNQ99538 433 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 PREBQ9HCU5 417 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ST7Q9NRC1 585 aa14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 27.8
NFE4-201ENST00000420058 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 A0A1W2PQU0 124 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 TCAF2A6NFQ2 919 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 E5RJQ4 531 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 F5H5T6 163 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ALOX15BO15296 676 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 FFAR2O15552 330 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 USP12O75317 370 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ACADSBP45954 432 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 KRT85P78386 507 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 SKOR1P84550 965 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 GCNT1Q02742 428 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 CENPCQ03188 943 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ARTNQ5T4W7 220 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ARHGAP40Q5TG30 622 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 DSG4Q86SJ6 1040 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 C14orf80Q86SX3 495 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 WDTC1Q8N5D0 677 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 SH2D3CQ8N5H7 860 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 APOLD1Q96LR9 279 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 MYOCQ99972 504 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 FZD3Q9NPG1 666 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ACP6Q9NPH0 428 aa14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 RP1P56715 2156 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 K7ERQ8 282 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 SCAMP1O15126 338 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 CLDN2P57739 230 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 GABREP78334 506 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 NUCB2P80303 420 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 DAB2P98082 770 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 RHDQ02161 417 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 LRRC63Q05C16 580 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 C5orf22Q49AR2 442 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ACCSLQ4AC99 568 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 NEK5Q6P3R8 708 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 GCNT7Q6ZNI0 430 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 FAM181AQ8N9Y4 354 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 OR2A12Q8NGT7 310 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 BMFQ96LC9 184 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 GSDMAQ96QA5 445 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 PSMB7Q99436 277 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 TSG101Q99816 390 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.61□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 THAP9Q9H5L6 903 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms