RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa30.8■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 KIAA1211LQ6NV74 962 aa30.8■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF366Q8N895 744 aa30.8■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 KDM1BQ8NB78 822 aa30.8■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 FAF2Q96CS3 445 aa30.8■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 RASA4BC9J798 803 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 CBX4O00257 560 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 RASA4O43374 803 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 NDST2P52849 883 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 PCDH19Q8TAB3 1148 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 KRT35Q92764 455 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 ERLEC1Q96DZ1 483 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 HMCESQ96FZ2 354 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 HHIPQ96QV1 700 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 FBXO4Q9UKT5 387 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 MT-CO1P00395 513 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 KRT1P04264 644 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 DGKEP52429 567 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 ST8SIA6P61647 398 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 PARP15Q460N3 678 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 AFMIDQ63HM1 303 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 NT5DC3Q86UY8 548 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 NETO2Q8NC67 525 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 SLC39A8Q9C0K1 460 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 SLC25A13Q9UJS0 675 aa30.79■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 EPHX1P07099 455 aa30.78■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 VASPP50552 380 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 ARF5P84085 180 aa30.78■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 TMCO3Q6UWJ1 677 aa30.78■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 LINGO4Q6UY18 593 aa30.78■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 MTG2Q9H4K7 406 aa30.78■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 HS3ST2Q9Y278 367 aa30.78■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 TTC34A8MYJ7 566 aa30.77■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 SERINC3Q13530 473 aa30.77■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 TP53INP2Q8IXH6 220 aa30.77■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 SYCE1Q8N0S2 351 aa30.77■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 CAMKK1Q8N5S9 505 aa30.77■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 LZTR1Q8N653 840 aa30.77■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 PRSS33Q8NF86 280 aa30.77■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa30.77■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 KDELR3O43731 214 aa30.76■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 NNMTP40261 264 aa30.76■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 MFSD7Q6UXD7 560 aa30.76■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 VSIG1Q86XK7 387 aa30.76■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 KATNAL2Q8IYT4 538 aa30.76■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 SH2D3CQ8N5H7 860 aa30.76■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 PQLC3Q8N755 202 aa30.76■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 TSTD1Q8NFU3 115 aa30.76■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 RNF157Q96PX1 679 aa30.76■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 PRRX2Q99811 253 aa30.76■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 ACTL7AQ9Y615 435 aa30.76■■■□□ 2.52
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF487B1APH4 448 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 CD160O95971 181 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 RETSATQ6NUM9 610 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 AMFRQ9UKV5 643 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 HPCAL4Q9UM19 191 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 K7ERQ8 282 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 ATP9BO43861 1147 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 FTCDO95954 541 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 SRCP12931 536 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 CTNNA2P26232 953 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 HOXA6P31267 233 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 PXNP49023 591 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
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PKDCC-202ENST00000401498 TCF15Q12870 199 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 ODF2Q5BJF6 829 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 PEX26Q7Z412 305 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF354CQ86Y25 554 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 FRS2Q8WU20 508 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 SUN2Q9UH99 717 aa30.75■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
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PKDCC-202ENST00000401498 SP9P0CG40 484 aa30.74■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 PEX5P50542 639 aa30.74■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 SLC20A2Q08357 652 aa30.74■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 STARD3Q14849 445 aa30.74■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 DLG2Q15700 870 aa30.74■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 ATP11CQ8NB49 1132 aa30.74■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 PRSS16Q9NQE7 514 aa30.74■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa30.73■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC66A2RUB6 948 aa30.73■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGAP42A6NI28 874 aa30.73■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 APBB3O95704 486 aa30.73■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 TAZQ16635 292 aa30.73■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF528Q3MIS6 628 aa30.73■■■□□ 2.51
PKDCC-202ENST00000401498 ANO7Q6IWH7 933 aa30.73■■■□□ 2.51
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