RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391266.1

RNU6-1254P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1254, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1254P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM185AQ8N0U4 392 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LINC00612Q8N6U2 182 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RFWD2Q8NHY2 731 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IL31RAQ8NI17 732 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMEM163Q8TC26 289 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC35F5Q8WV83 523 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HPS3Q969F9 1004 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TXNDC15Q96J42 360 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 VGLL1Q99990 258 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRIM15Q9C019 465 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LRFN1Q9P244 771 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CLIP2Q9UDT6 1046 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FBXO4Q9UKT5 387 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1254P-201ENST00000391266 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A0A0J9YWU9 116 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A0A1B0GVM2 712 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LILRA5A6NI73 299 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF587BE7ETH6 402 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 E9PSI1 815 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TUBBP07437 444 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PRSS1P07477 247 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ARP10275 920 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NCLP19338 710 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 AKAP5P24588 427 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HTR1BP28222 390 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CHRNA5P30532 468 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC7A1P30825 629 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CDH12P55289 794 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GNB1P62873 340 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TUBB4BP68371 445 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RUNX1T1Q06455 604 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ITKQ08881 620 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SEMA5AQ13591 1074 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SYT16Q17RD7 645 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM69BQ5VUD6 431 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF774Q6NX45 483 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LCTLQ6UWM7 567 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DSG4Q86SJ6 1040 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NFE4Q86UQ8 179 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SATL1Q86VE3 508 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CCDC25Q86WR0 208 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HORMAD2Q8N7B1 307 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TEX45Q8NA69 505 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OVCA2Q8WZ82 227 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KLHL29Q96CT2 875 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ALG14Q96F25 216 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF333Q96JL9 665 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LINC00479Q96M42 142 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MAP3K14Q99558 947 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ASCL2Q99929 193 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC25A32Q9H2D1 315 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SACM1LQ9NTJ5 587 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TAAR2Q9P1P5 351 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CGNL1Q0VF96 1302 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A0A1W2PS18 150 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NDUFAF8A1L188 74 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HSPB6O14558 160 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KATNA1O75449 491 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 UBXN7O94888 489 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KDM4BO94953 1096 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 INMTO95050 263 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CLDN7O95471 211 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CLDN14O95500 239 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IL33O95760 270 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LINC00271P0C7V0 271 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MYZAPP0CAP1 466 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 UNGP13051 313 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IGFBP2P18065 325 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CCND1P24385 295 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MCM3P25205 808 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KLRC2P26717 231 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CDC25CP30307 473 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FMO4P31512 558 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RPS16P62249 146 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RHAGQ02094 409 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RIGQ13278 110 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms