RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 MBD3O95983 291 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 PROS1P07225 676 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 TBC1D3HP0C7X1 549 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 OR1E1P30953 314 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 JAM2P57087 298 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 FMO1Q01740 532 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 UBXN1Q04323 297 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 TRNP1Q6NT89 227 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 TRIM72Q6ZMU5 477 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 SH2D3CQ8N5H7 860 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 TMEM59LQ9UK28 342 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 KLK13Q9UKR3 277 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 OR51B4Q9Y5P0 310 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 LGALS16A8MUM7 142 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 KCNK3O14649 394 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 SNAP91O60641 907 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 KRT37O76014 449 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 FTH1P19P0C7X4 201 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 SDC4P31431 198 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 NSFP46459 744 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 VASPP50552 380 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 CCR5P51681 352 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 METAP1P53582 386 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC183Q5T5S1 534 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 DCAF4L2Q8NA75 395 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 SLC30A5Q8TAD4 765 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 RHBDD1Q8TEB9 315 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 C1orf74Q96LT6 269 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 ORAI3Q9BRQ5 295 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 VPS51Q9UID3 782 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 SIK3Q9Y2K2 1263 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 CEP295Q9C0D2 2601 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 ALOX15BO15296 676 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 RTN2O75298 545 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 SRCP12931 536 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 MMP8P22894 467 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 DRD3P35462 400 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 IL9RQ01113 521 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 ARL13BQ3SXY8 428 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 SLC45A4Q5BKX6 768 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 ARCQ7LC44 396 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF683Q8IZ20 524 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 SERAC1Q96JX3 654 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 HAPLN3Q96S86 360 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 PSMB7Q99436 277 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 SPON2Q9BUD6 331 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 HS3ST2Q9Y278 367 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 DRGXA6NNA5 263 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 H0Y8X5 98 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 MCF2LO15068 1137 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 VILLO15195 856 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 SLC7A4O43246 635 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 CHRNB2P17787 502 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 CTSKP43235 329 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 PPP2CBP62714 309 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 PPP2CAP67775 309 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 INAVAQ3KP66 663 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 LINGO4Q6UY18 593 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 PNPLA1Q8N8W4 532 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 ZYG11BQ9C0D3 744 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 SARDHQ9UL12 918 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 A0A0D9SEW6 157 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 CBX4O00257 560 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 CBFA2T3O75081 653 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 RRM1P23921 792 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 CD38P28907 300 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 CNTN1Q12860 1018 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 KCNT1Q5JUK3 1230 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 DRC7Q8IY82 874 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 OR7D4Q8NG98 312 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 RXFP2Q8WXD0 754 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 CDC6Q99741 560 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 SELENOOQ9BVL4 669 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 EBF2Q9HAK2 575 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 DYRK4Q9NR20 520 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 PPM1HQ9ULR3 514 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 DOCK4Q8N1I0 1966 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 GOLGA8CPA6NN73 597 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 K7ERQ8 282 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 MT-CO1P00395 513 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 GRK6P43250 576 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-202ENST00000378546 CLCN6P51797 869 aa26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms