RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371146.5

USP1-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene USP1, Length 3,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1-202ENST00000371146 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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USP1-202ENST00000371146 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa7.2□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.2□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 ACSL4O60488 711 aa7.2□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 TACR2P21452 398 aa7.2□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 NOS2P35228 1153 aa7.2□□□□□ -1.26
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USP1-202ENST00000371146 SLC30A9Q6PML9 568 aa7.2□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 RAD9BQ6WBX8 426 aa7.2□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 SCD5Q86SK9 330 aa7.2□□□□□ -1.26
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USP1-202ENST00000371146 ADHFE1Q8IWW8 467 aa7.2□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 BBS5Q8N3I7 341 aa7.2□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 ATPAF2Q8N5M1 289 aa7.2□□□□□ -1.26
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USP1-202ENST00000371146 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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USP1-202ENST00000371146 CARNS1A5YM72 827 aa7.2□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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USP1-202ENST00000371146 STC2O76061 302 aa7.2□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 MT-CO1P00395 513 aa7.2□□□□□ -1.26
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USP1-202ENST00000371146 GEN1Q17RS7 908 aa7.2□□□□□ -1.26
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USP1-202ENST00000371146 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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USP1-202ENST00000371146 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
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USP1-202ENST00000371146 DPH5Q9H2P9 285 aa7.19□□□□□ -1.26
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USP1-202ENST00000371146 DGKKQ5KSL6 1271 aa7.19□□□□□ -1.26
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USP1-202ENST00000371146 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa7.19□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.19□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa7.19□□□□□ -1.26
USP1-202ENST00000371146 CD101Q93033 1021 aa7.19□□□□□ -1.26
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