RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGAP18Q8N392 663 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 POU5F2Q8N7G0 328 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 OR6Y1Q8NGX8 325 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 EDEM1Q92611 657 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 CMTM5Q96DZ9 223 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PGLYRP2Q96PD5 576 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 RTP3Q9BQQ7 232 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 NAT9Q9BTE0 207 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 DDIT4Q9NX09 232 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 CDH9Q9ULB4 789 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PSAT1Q9Y617 370 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PGK1P00558 417 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 ZCCHC18P0CG32 403 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPN3P26045 913 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 TPI1P60174 286 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 RALGPS1Q5JS13 557 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 ACAD11Q709F0 780 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PID1Q7Z2X4 250 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 SHKBP1Q8TBC3 707 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 FERMT1Q9BQL6 677 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 CHST12Q9NRB3 414 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PRKCGP05129 697 aa24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 ASPHQ12797 758 aa24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 UPP1Q16831 310 aa24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PYDC1Q8WXC3 89 aa24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM4Q9C037 500 aa24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PNPOQ9NVS9 261 aa24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 COPG2Q9UBF2 871 aa24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 SNX10Q9Y5X0 201 aa24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 NUP205Q92621 2012 aa24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 HARS2P49590 506 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 POLE2P56282 527 aa24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 XIAPP98170 497 aa24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PDPK2PQ6A1A2 396 aa24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 CES3Q6UWW8 571 aa24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 IFNL1Q8IU54 200 aa24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 COLEC11Q9BWP8 271 aa24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 CDH22Q9UJ99 828 aa24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 GIT1Q9Y2X7 761 aa24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF195O14628 629 aa24.36■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 CCNIQ14094 377 aa24.36■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 RASSF3Q86WH2 238 aa24.36■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 MYLPFQ96A32 169 aa24.36■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 SMARCD1Q96GM5 515 aa24.36■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 EBF3Q9H4W6 596 aa24.36■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 RALBP11234 206 aa24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 HCAR3P49019 387 aa24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 CDK7P50613 346 aa24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 MGAT3Q09327 533 aa24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 ATG14Q6ZNE5 492 aa24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 RSPH3Q86UC2 560 aa24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 SERINC5Q86VE9 423 aa24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 OR52K1Q8NGK4 314 aa24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC26A7Q8TE54 656 aa24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 USP12O75317 370 aa24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 MX2P20592 715 aa24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 EPHB1P54762 984 aa24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 RNF111Q6ZNA4 994 aa24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 AGAP3Q96P47 875 aa24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM216Q9P0N5 145 aa24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 MGEA5O60502 916 aa24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 KPNA6O60684 536 aa24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 ARRB2P32121 409 aa24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 AZIN2Q96A70 460 aa24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 KLHL4Q9C0H6 718 aa24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 TXNDC16Q9P2K2 825 aa24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 SHROOM3Q8TF72 1996 aa24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 ERVK-10P10266 1014 aa24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 CYBAP13498 195 aa24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 TYK2P29597 1187 aa24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PRDX6P30041 224 aa24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 RPL9P32969 192 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 CD68P34810 354 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 GARSP41250 739 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 RAB27AP51159 221 aa24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC153Q494R4 210 aa24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 TKTL2Q9H0I9 626 aa24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PDE5AO76074 875 aa24.33■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 POMCP01189 267 aa24.33■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PCSK1P29120 753 aa24.33■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 GP5P40197 560 aa24.33■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 BRCC3P46736 316 aa24.33■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 CXCR3P49682 368 aa24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms