RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABCB10Q9NRK6 738 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 RXFP3Q9NSD7 469 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SACM1LQ9NTJ5 587 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 GABBR1Q9UBS5 961 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 FBXO4Q9UKT5 387 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF318Q5VUA4 2279 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 USP19O94966 1318 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A0U1RQJ8 604 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 DYTNA2CJ06 578 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 PMS2P5A8MQ11 134 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBXN7O94888 489 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 INMTO95050 263 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 LCKP06239 509 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARP10275 920 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 NCLP19338 710 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 BTF3P20290 206 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCND1P24385 295 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 AKAP5P24588 427 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 MXI1P50539 228 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 NLRP5P59047 1200 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPS16P62249 146 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SHC2P98077 582 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZBTB17Q13105 803 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEMA3BQ13214 749 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 XKR9Q5GH70 373 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATAT1Q5SQI0 421 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 C10orf76Q5T2E6 689 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAAP20Q6NZ36 180 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGFL3Q6UXB1 125 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRT28Q7Z3Y7 464 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 MDGA2Q7Z553 956 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC25Q86WR0 208 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 YAF2Q8IY57 180 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 PGBD5Q8N414 524 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 HORMAD2Q8N7B1 307 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q8N7P7 452 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF441Q8N8Z8 693 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CNBD1Q8NA66 436 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR13A1Q8NGR1 328 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 RFWD2Q8NHY2 731 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP1R35Q8TAP8 253 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 NPIPB3Q92617 1050 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 DRC1Q96MC2 740 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 C17orf77Q96MU5 243 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 EBF2Q9HAK2 575 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTPRHQ9HD43 1115 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAPN11Q9UMQ6 739 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 AGRNO00468 2067 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 MCIDASD6RGH6 385 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 H3BML4 177 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 C16orf97H3BN30 126 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITM2AO43736 263 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 OFD1O75665 1012 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 PMS2P2O95744 297 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 TUBBP07437 444 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSD3B2P26439 372 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 TYK2P29597 1187 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHRNA5P30532 468 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 BRWD1-AS2P59051 145 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 TUBB4BP68371 445 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZBTB16Q05516 673 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPS1Q13098 491 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 PKP1Q13835 747 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYBPC2Q14324 1141 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 METTL7BQ6UX53 244 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 UNC13DQ70J99 1090 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 MON1BQ7L1V2 547 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM185AQ8N0U4 392 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEP76Q8TAP6 659 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM163Q8TC26 289 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC35F5Q8WV83 523 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 OVCA2Q8WZ82 227 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 SUCLG2Q96I99 432 aa0.67□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms