RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 TREML1Q86YW5 311 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 EBF4Q9BQW3 602 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 IL22Q9GZX6 179 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 COPG2Q9UBF2 871 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 ADAM28Q9UKQ2 775 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 NOD1Q9Y239 953 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 FRMPD3Q5JV73 1810 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 SERPINB8P50452 374 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 COG7P83436 770 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 TSPY1Q01534 308 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 BLMHQ13867 455 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 KCNMB4Q86W47 210 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 CNTD1Q8N815 330 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 CFAP61Q8NHU2 1237 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 DPF3Q92784 378 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 SUSD3Q96L08 255 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 TRIM62Q9BVG3 475 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 RNF186Q9NXI6 227 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 LRRC42Q9Y546 428 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 TTC3P53804 2025 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 IGLV3-25P01717 112 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 ABCG1P45844 678 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 BTBD8Q5XKL5 378 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 ISL2Q96A47 359 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF778Q96MU6 729 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 UROC1Q96N76 676 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-202ENST00000323081 H0Y3Z8 333 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 IRAK2O43187 625 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 CYP2C18P33260 490 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 GRIK1P39086 918 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 MAGEA12P43365 314 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 PGFP49763 221 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 SLC5A3P53794 718 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 CDH17Q12864 832 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 MPP3Q13368 585 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 RCN2Q14257 317 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 SIKE1Q9BRV8 207 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 CAB39LQ9H9S4 337 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 ABCC13Q9NSE7 274 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 SOX13Q9UN79 622 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 NEU3Q9UQ49 428 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 B2RBV5 119 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 GOLGA8TH3BQL2 631 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 MSI1O43347 362 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 NEBLO76041 1014 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 SERPINA6P08185 405 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 RALBP11234 206 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 CPA3P15088 417 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 GRK2P25098 689 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 NMBRP28336 390 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC153Q494R4 210 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 BEND5Q7L4P6 421 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 TNS4Q8IZW8 715 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 ATPAF2Q8N5M1 289 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 PPP4R1Q8TF05 950 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 HAPLN3Q96S86 360 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC106Q9BWC9 280 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 A0A096LPK6 155 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC78A2IDD5 438 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 INPPL1O15357 1258 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 PAGE1O75459 146 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 CCNCP24863 283 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 KDSRQ06136 332 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF33AQ06730 810 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 DLG2Q15700 870 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 ATG14Q6ZNE5 492 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 LINC00523Q86TU6 105 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF280BQ86YH2 543 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 SPATA22Q8NHS9 363 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 TSGA13Q96PP4 275 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 DCLRE1BQ9H816 532 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 TAGLN3Q9UI15 199 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 AP3B1O00203 1094 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 TNFRSF10BO14763 440 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 PSMD3O43242 534 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 DDHD2O94830 711 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS1-202ENST00000323081 MPOP05164 745 aa17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms