RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296387.5

CLDN19-201, Transcript of claudin 19, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CLDN19, Length 2,859 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19-201ENST00000296387 ANKRD52Q8NB46 1076 aa12.89□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 KLHL32Q96NJ5 620 aa12.89□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 NPAS2Q99743 824 aa12.89□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 NAT9Q9BTE0 207 aa12.89□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 LRRC40Q9H9A6 602 aa12.89□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 OXSMQ9NWU1 459 aa12.89□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 NUP205Q92621 2012 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 CLDN5O00501 218 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 GRID2O43424 1007 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 DENRO43583 198 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 USP2O75604 605 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 TRPA1O75762 1119 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 CNMDO75829 334 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 GLUD2P49448 558 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 NUMBP49757 651 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 MPP3Q13368 585 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 GRM3Q14832 879 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 PDK1Q15118 436 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 MYLK3Q32MK0 819 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 SH3D19Q5HYK7 790 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 HFE2Q6ZVN8 426 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 RNF169Q8NCN4 708 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 VPS39Q96JC1 886 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 A0A0G2JMZ2 1700 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 LRRC37A2A6NM11 1700 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 KPNA7A9QM74 516 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 M0QYT0 321 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 SPTLC1O15269 473 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 AP1G1O43747 822 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 BEST1O76090 585 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 TOMM70O94826 608 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 STAU1O95793 577 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 LGALS2P05162 132 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 NELFEP18615 380 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 TFEBP19484 476 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 PTPN3P26045 913 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 MATKP42679 507 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 RPL5P46777 297 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 KIZQ2M2Z5 673 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 SEL1L3Q68CR1 1132 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 KCNMB4Q86W47 210 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 ZFP28Q8NHY6 868 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 ISL2Q96A47 359 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 SCYL1Q96KG9 808 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 ANLNQ9NQW6 1124 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 IRAK4Q9NWZ3 460 aa12.88□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 TMEM114B3SHH9 223 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 HDAC3O15379 428 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 ASLP04424 464 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 AKAP5P24588 427 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 NMBRP28336 390 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 RPL14P50914 215 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 BCAT1P54687 386 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 C16orf89Q6UX73 402 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 PIGZQ86VD9 579 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 TMEM151AQ8N4L1 468 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 TTC39CQ8N584 583 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 AFG1LQ8WV93 481 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 KCTD4Q8WVF5 259 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 OMDQ99983 421 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 WDR41Q9HAD4 459 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 BFARQ9NZS9 450 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 FIS1Q9Y3D6 152 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 I6L893 689 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 USP46P62068 366 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 NRF1Q16656 503 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 TBC1D25Q3MII6 688 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 SLC25A52Q3SY17 297 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 METTL21CQ5VZV1 264 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 ARHGAP17Q68EM7 881 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 STRADAQ7RTN6 431 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 TMEM135Q86UB9 458 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 SNX31Q8N9S9 440 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 FAM81AQ8TBF8 368 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 PHF12Q96QT6 1004 aa12.87□□□□□ -0.35
CLDN19-201ENST00000296387 SERPINI1Q99574 410 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms