RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 APOL1O14791 398 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 MFSD11O43934 449 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 DCNP07585 359 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 PYGMP11217 842 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 TIE1P35590 1138 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 ARF5P84085 180 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 ECT2LQ008S8 904 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 SERINC3Q13530 473 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 TFDP2Q14188 446 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF234Q14588 700 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 RPS6KA1Q15418 735 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 C2orf27AQ580R0 203 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF569Q5MCW4 686 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 DCAF12L1Q5VU92 463 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 IL31Q6EBC2 164 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 PKN3Q6P5Z2 889 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC50Q8IVM0 306 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 SPEM1Q8N4L4 309 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM105Q8N8V8 129 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 IL17RCQ8NAC3 791 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 TLR10Q9BXR5 811 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 CARD9Q9H257 536 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 MMP17Q9ULZ9 603 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 PLA2G4CQ9UP65 541 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 ERVW-1Q9UQF0 538 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 HS3ST2Q9Y278 367 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 JRKLQ9Y4A0 524 aa13.54□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 FAM86C2PA6NEL3 165 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 KDELR3O43731 214 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 SNAP91O60641 907 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 ATG13O75143 517 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 KRT10P13645 584 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 GLDCP23378 1020 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 NTSR1P30989 418 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 CETN2P41208 172 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 IL12RB1P42701 662 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 SLC20A2Q08357 652 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 RETSATQ6NUM9 610 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 BBS12Q6ZW61 710 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 SYT13Q7L8C5 426 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 RFX6Q8HWS3 928 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 CHPFQ8IZ52 775 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 SLC35F6Q8N357 371 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 ALLCQ8N6M5 410 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 ACOX2Q99424 681 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 GABRG3Q99928 467 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 SPON2Q9BUD6 331 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 OSBPL8Q9BZF1 889 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM245Q9H330 911 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 PDFQ9HBH1 243 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A13Q9UJS0 675 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 HPCAL4Q9UM19 191 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 RAD54BQ9Y620 910 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 STON1Q9Y6Q2 735 aa13.53□□□□□ -0.24
CCDC42-201ENST00000293845 CBX4O00257 560 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ATP9BO43861 1147 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CST8O60676 142 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ADAM23O75077 832 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TGM2P21980 687 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 STK19P49842 368 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 DNA2P51530 1060 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CLCN6P51797 869 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ST8SIA6P61647 398 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 GBE1Q04446 702 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ADCY2Q08462 1091 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 GALNT2Q10471 571 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 MTAPQ13126 283 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM31Q5JXX7 168 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 EOGTQ5NDL2 527 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC49Q8IUZ0 686 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TP53INP2Q8IXH6 220 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SH2D3CQ8N5H7 860 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 HERPUD2Q9BSE4 406 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 DTLQ9NZJ0 730 aa13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SGK1O00141 431 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 DFFAO00273 331 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 DLL1O00548 723 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PRAMEF11O60813 436 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CD160O95971 181 aa13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms