RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 STC2O76061 302 aa11.22□□□□□ -0.61
GGPS1-201ENST00000282841 CPP00450 1065 aa11.22□□□□□ -0.61
GGPS1-201ENST00000282841 AGTP01019 485 aa11.22□□□□□ -0.61
GGPS1-201ENST00000282841 HLA-DQB2P05538 268 aa11.22□□□□□ -0.61
GGPS1-201ENST00000282841 C8AP07357 584 aa11.22□□□□□ -0.61
GGPS1-201ENST00000282841 CSH1P0DML2 217 aa11.22□□□□□ -0.61
GGPS1-201ENST00000282841 CSH2P0DML3 217 aa11.22□□□□□ -0.61
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GGPS1-201ENST00000282841 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
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GGPS1-201ENST00000282841 E7ESA3 106 aa11.21□□□□□ -0.62
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GGPS1-201ENST00000282841 HDCP19113 662 aa11.21□□□□□ -0.62
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GGPS1-201ENST00000282841 BMPR1AP36894 532 aa11.2□□□□□ -0.62
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GGPS1-201ENST00000282841 TCEAL8Q8IYN2 117 aa11.2□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 C1orf74Q96LT6 269 aa11.2□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 CCDC77Q9BR77 488 aa11.2□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 APOL5Q9BWW9 433 aa11.2□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa11.2□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 DOCK4Q8N1I0 1966 aa11.2□□□□□ -0.62
GGPS1-201ENST00000282841 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
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