RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267328.4

RAB20-201, Transcript of RAB20, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB20, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20-201ENST00000267328 DFFAO00273 331 aa24.17■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 CEP104O60308 925 aa24.17■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 ASLP04424 464 aa24.17■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 MX2P20592 715 aa24.17■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 UCMAQ8WVF2 138 aa24.17■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 CIPCQ9C0C6 399 aa24.17■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 NCAM2O15394 837 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 SNAP91O60641 907 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 MAP3K6O95382 1288 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 DLDP09622 509 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 CHRNB1P11230 501 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 GLDCP23378 1020 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 GARSP41250 739 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 NUMBP49757 651 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 ARF5P84085 180 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 COG1Q8WTW3 980 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 P3H4Q92791 437 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 HDAC11Q96DB2 347 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 OSBPL6Q9BZF3 934 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 HCN2Q9UL51 889 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 HPCAL4Q9UM19 191 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 SAR1BQ9Y6B6 198 aa24.16■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 CBX4O00257 560 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 VASPP50552 380 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 ECT2LQ008S8 904 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 NOMO1Q15155 1222 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 DGKKQ5KSL6 1271 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 CCDC181Q5TID7 509 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 ZNF354CQ86Y25 554 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 ATPAF2Q8N5M1 289 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 KCNV2Q8TDN2 545 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 FOXQ1Q9C009 403 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 SHROOM3Q8TF72 1996 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 PRAMEF11O60813 436 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 FGGP02679 453 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 FZD5Q13467 585 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 LRRC32Q14392 662 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 UBXN2BQ14CS0 331 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 PDK1Q15118 436 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 E2F5Q15329 346 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 PTPRNQ16849 979 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 SYNPOQ8N3V7 929 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 TTC13Q8NBP0 860 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 CCDC26Q8TAB7 109 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 SORCS1Q8WY21 1168 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 HAUS1Q96CS2 278 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 MRGPRX3Q96LB0 322 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 TSGA13Q96PP4 275 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 PDFQ9HBH1 243 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 ERVW-1Q9UQF0 538 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 HS3ST2Q9Y278 367 aa24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RAB20-201ENST00000267328 ATG2BQ96BY7 2078 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 ANTXRLA6NF34 631 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 FAM170BA6NMN3 283 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 MAFKO60675 156 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 IL10RBQ08334 325 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 SLC20A2Q08357 652 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 RETSATQ6NUM9 610 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 CCDC33Q8N5R6 958 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 KDM1BQ8NB78 822 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 PJA1Q8NG27 643 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 ACTL9Q8TC94 416 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 ACTRT1Q8TDG2 376 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 MAIP1Q8WWC4 291 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 MYO19Q96H55 970 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 SP110Q9HB58 689 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 SLC25A13Q9UJS0 675 aa24.14■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 J3KR12 359 aa24.13■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 NPC1O15118 1278 aa24.13■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 ZNF185O15231 689 aa24.13■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 CD160O95971 181 aa24.13■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 ZNF33AQ06730 810 aa24.13■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 EMC10Q5UCC4 262 aa24.13■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa24.13■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 MS4A14Q96JA4 679 aa24.13■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 BRD8Q9H0E9 1235 aa24.13■■□□□ 1.45
RAB20-201ENST00000267328 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms