RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 ITGAVP06756 1048 aa21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 GGCXP38435 758 aa21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 SULT1E1P49888 294 aa21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 DEUP1Q05D60 604 aa21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 KCNMA1Q12791 1236 aa21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 MFSD2AQ8NA29 543 aa21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 C1orf74Q96LT6 269 aa21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 SARDHQ9UL12 918 aa21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 WNT9AO14904 365 aa21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 MAGEC1O60732 1142 aa21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 RHOCP08134 193 aa21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC15Q0P6D6 951 aa21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 OXR1Q8N573 874 aa21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC114Q96M63 670 aa21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 DMTF1Q9Y222 760 aa21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 HS3ST2Q9Y278 367 aa21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 DRGXA6NNA5 263 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 BNIP3LO60238 219 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 RTN2O75298 545 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 CNTN5O94779 1100 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 METAP1P53582 386 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 NXPH1P58417 271 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 PPP2CBP62714 309 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 PPP2CAP67775 309 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 CNTN1Q12860 1018 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 ALFQ53S48 1182 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 Q6ZVU0 165 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 GATAD2AQ86YP4 633 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 ATP11CQ8NB49 1132 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 SAP25Q8TEE9 199 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 STK33Q9BYT3 514 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 KNTC1P50748 2209 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 PLK4O00444 970 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 LSM8O95777 96 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 SRCP12931 536 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 UCHL3P15374 230 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 OVGP1Q12889 678 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 STAT4Q14765 748 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 SHBQ15464 509 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC157Q569K6 752 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 C6orf118Q5T5N4 469 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 TAF3Q5VWG9 929 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 PKD1L2Q7Z442 2459 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 IQCHQ86VS3 1027 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM69Q86WT6 500 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 XYLT1Q86Y38 959 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 TBCBQ99426 244 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 ANLNQ9NQW6 1124 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 MT-CO1P00395 513 aa21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 CDK4P11802 303 aa21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 RXRGP48443 463 aa21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 AGBL4Q5VU57 503 aa21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF683Q8IZ20 524 aa21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 HAPLN3Q96S86 360 aa21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 PSMB7Q99436 277 aa21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 PREBQ9HCU5 417 aa21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 VPS51Q9UID3 782 aa21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 LHX6Q9UPM6 363 aa21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-201ENST00000250495 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 I6L893 689 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 ENC1O14682 589 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 ZZEF1O43149 2961 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 SNAP91O60641 907 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 C1SP09871 688 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 OR1E1P30953 314 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 CHRNA3P32297 505 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 CLCN6P51797 869 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 POM121L1PQ3SYA9 428 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 TCP11X2Q5H9J9 407 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 NEK5Q6P3R8 708 aa21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms