RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233330.6

RTKN-201, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTKN, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-201ENST00000233330 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 TUBP50607 506 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 LIMK2P53671 638 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 INSCQ1MX18 579 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 PPM1JQ5JR12 505 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 AFMIDQ63HM1 303 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 LHX8Q68G74 356 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 CCDC91Q7Z6B0 441 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 KCNMB4Q86W47 210 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 DCLK2Q8N568 766 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 RAET1EQ8TD07 263 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 FCRL5Q96RD9 977 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 FBXO44Q9H4M3 255 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 SNX15Q9NRS6 342 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.08■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 HAUS5O94927 633 aa20.08■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 PRKCGP05129 697 aa20.08■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 DNAJB2P25686 324 aa20.08■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 RASSF2P50749 326 aa20.08■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 STX3Q13277 289 aa20.08■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa20.08■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 C14orf80Q86SX3 495 aa20.08■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.08■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.08■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.08■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 A8MUI8 341 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 USP46P62068 366 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 PIK3R6Q5UE93 754 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 ICE2Q659A1 982 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 MBLAC2Q68D91 279 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 SLC39A13Q96H72 371 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 GLOD4Q9HC38 313 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 THAP1Q9NVV9 213 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 MPP6Q9NZW5 540 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 PROCP04070 461 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 NMBRP28336 390 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 SERPINB8P50452 374 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 ZBTB16Q05516 673 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 AZIN2Q96A70 460 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 C1orf74Q96LT6 269 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 KIFC1Q9BW19 673 aa20.07■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 ANXA9O76027 345 aa20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 MAGEA11P43364 429 aa20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 CDK18Q07002 472 aa20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 PCLAFQ15004 111 aa20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 LRRC8DQ7L1W4 858 aa20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 GMIPQ9P107 970 aa20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 WASH4PA8MWX3 477 aa20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 COL6A1P12109 1028 aa20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 ARHGAP18Q8N392 663 aa20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 ZNF778Q96MU6 729 aa20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 IL37Q9NZH6 218 aa20.06■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 INHAP05111 366 aa20.05■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 HLA-DQB2P05538 268 aa20.05■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 KCNA4P22459 653 aa20.05■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 PTPN4P29074 926 aa20.05■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 GMPRP36959 345 aa20.05■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 MPP3Q13368 585 aa20.05■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.05■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 CEP57Q86XR8 500 aa20.05■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.05■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa20.05■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
RTKN-201ENST00000233330 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms