RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229328.9

PRKAB1-201, Transcript of protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAB1, Length 2,610 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1-201ENST00000229328 GLOD4Q9HC38 313 aa14.71□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.71□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.71□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 BPTFQ12830 3046 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 HLA-DQB2P05538 268 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 CNTFP26441 200 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 NCALDP61601 193 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 BNIP1Q12981 228 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 PRPSAP1Q14558 356 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 ALFQ53S48 1182 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 C16orf46Q6P387 395 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 ECT2Q9H8V3 914 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 DCTN4Q9UJW0 460 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 USP1O94782 785 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 UPP2O95045 317 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 NMBRP28336 390 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 ABCG1P45844 678 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 NPY2RP49146 381 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 PRMT2P55345 433 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 IRX4P78413 519 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 NAB1Q13506 487 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 PPM1JQ5JR12 505 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 C10orf120Q5SQS8 335 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 IPMKQ8NFU5 416 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 42.3
PRKAB1-201ENST00000229328 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 NUMBLQ9Y6R0 609 aa14.7□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 GOLGA8TH3BQL2 631 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 CDH17Q12864 832 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 ARHGEF6Q15052 776 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.063e-8■■□□□ 14.2
PRKAB1-201ENST00000229328 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 IGSF8Q969P0 613 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 FCRL5Q96RD9 977 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 TTPALQ9BTX7 342 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 HIPK3Q9H422 1215 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 EMCNQ9ULC0 261 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 E2F8A0AVK6 867 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 WASH4PA8MWX3 477 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 RASSF9O75901 435 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 SLC2A3P11169 496 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 ATF6P18850 670 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 GP5P40197 560 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 DENND5AQ6IQ26 1287 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 MYEOVQ96EZ4 313 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 IL22Q9GZX6 179 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 SOX13Q9UN79 622 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.69□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 SLC12A8A0AV02 714 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 J3KR12 359 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 PEX11BO96011 259 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 GSRP00390 522 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 FYB2Q5VWT5 728 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 FBXL22Q6P050 247 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 ERP27Q96DN0 273 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 HMCESQ96FZ2 354 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 SPATA17Q96L03 361 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 CPNE1Q99829 537 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 TBL1YQ9BQ87 522 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 FICDQ9BVA6 458 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 SIRPGQ9P1W8 387 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 NUMBP49757 651 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 PDE1BQ01064 536 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 BST1Q10588 318 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.68□□□□□ -0.06
PRKAB1-201ENST00000229328 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms