RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 PMLP29590 882 aa22.55■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 LIPMQ5VYY2 423 aa22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF410Q86VK4 478 aa22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 PGAM4Q8N0Y7 254 aa22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 AGR3Q8TD06 166 aa22.55■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 IL22Q9GZX6 179 aa22.55■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 GJD2Q9UKL4 321 aa22.55■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 F7P08709 466 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 PRKAA1Q13131 559 aa22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 LCA5Q86VQ0 697 aa22.54■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 EPHA3P29320 983 aa22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 ABCG1P45844 678 aa22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 GRIA4P48058 902 aa22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.54■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.54■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 RCN3Q96D15 328 aa22.53■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF696Q9H7X3 374 aa22.53■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.53■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 SLC2A13Q96QE2 648 aa22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.53■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 AP4B1Q9Y6B7 739 aa22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa22.52■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 CD68P34810 354 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
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