RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000224820.1

Zkscan3-208, Transcript of Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

BASIC

Gene Zkscan3, Length 5,398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Smad9Q9JIW5 430 aa16.15■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa16.15■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Lgr4A2ARI4 951 aa16.14■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Skint11A7XV14 364 aa16.14■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm8257E9Q8R3 264 aa16.14■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Mmp10O55123 476 aa16.14■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Serpinb2P12388 415 aa16.14■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 GaaP70699 953 aa16.14■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Adcy6Q01341 1165 aa16.14■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Cd36Q08857 472 aa16.14■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 IdsQ08890 552 aa16.14■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Stk40Q7TNL3 435 aa16.14■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Thop1Q8C1A5 687 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Fam126bQ8C729 530 aa16.14■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Depdc7Q91WS7 511 aa16.14■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tmco1Q921L3 188 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ubxn6Q99PL6 442 aa16.14■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 AenQ9CZI9 336 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Adra1dP97714 562 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rad51Q08297 339 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Hmgb4Q6P8W9 181 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Slc18a2Q8BRU6 517 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Q9CPS8 106 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Pfdn1Q9CWM4 122 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Lrrc71Q9D3W5 558 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ddx21Q9JIK5 851 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Cntnap4Q99P47 1310 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm6205E9PZS2 359 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ppm1aP49443 382 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Pou1f1Q00286 291 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gpr65Q61038 337 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 CapslQ6P8Y1 208 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 GmppbQ8BTZ7 360 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm6367Q8C6L9 287 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Swi5Q8K3D3 89 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Olfr784Q8VFZ9 319 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 March8Q9DBD2 286 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 AcadsbQ9DBL1 432 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Clcn5Q9WVD4 746 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm28897A0A087WP44 222 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Kif1cO35071 1100 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Kcnj6P48542 425 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gpd2Q64521 727 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tnpo3Q6P2B1 923 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Pcdhb19Q91Y01 801 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 SncaipQ99ME3 962 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Bbs2Q9CWF6 721 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Cib4Q9D9N5 185 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 TfgQ9Z1A1 397 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Osbpl8B9EJ86 889 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm5814J3QP80 125 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Glt8d2Q640P4 349 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rbbp8Q80YR6 893 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Lrrc24Q8BHA1 521 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 HpgdQ8VCC1 269 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ppp1r16aQ923M0 524 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Mrfap1Q9CQL7 125 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Coro1cQ9WUM4 474 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Stk25Q9Z2W1 426 aa16.14■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Pknox1O70477 436 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Mks1Q5SW45 561 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Mtmr12Q80TA6 747 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Zswim5Q80TC6 1188 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Lrp8Q924X6 996 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ssxb1Q9CPU1 170 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 IkbkeQ9R0T8 717 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 CtcflA2APF3 636 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Zbed6D2EAC2 980 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 C6.1alQ7M757 291 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ppp2r1bQ7TNP2 601 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Slc41a1Q8BJA2 512 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rap2cQ8BU31 183 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 0610012G03RikA0A0J9YTR2 95 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Pkd2l1A2A259 760 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Srebf2Q3U1N2 1130 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Serac1Q3U213 654 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Cep44Q5HZK1 386 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 ChpfQ6IQX7 774 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rab36Q8CAM5 267 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Kctd2Q8CEZ0 266 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 CenpsQ9D084 142 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Deaf1Q9Z1T5 566 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Nfkbil1O88995 381 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Pax3P24610 479 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Serpina3cP29621 417 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Fscn1Q61553 493 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 VclQ64727 1066 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 March4Q80TE3 409 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Prdm4Q80V63 803 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tdp1Q8BJ37 609 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Slc39a13Q8BZH0 361 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Sfrp1Q8C4U3 314 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rdh13Q8CEE7 334 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 CherpQ8CGZ0 936 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Spon1Q8VCC9 807 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tmem68Q9D850 329 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Katna1Q9WV86 491 aa16.13■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Dhtkd1A2ATU0 921 aa16.12■□□□□ 0.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Armt1A6H630 439 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.3 ms