RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 HSPA12BQ96MM6 686 aa11.36□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 MCEEQ96PE7 176 aa11.36□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 FEM1AQ9BSK4 669 aa11.36□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 PCED1AQ9H1Q7 454 aa11.36□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 SMOC1Q9H4F8 434 aa11.36□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 HAUS4Q9H6D7 363 aa11.36□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 RETREG1Q9H6L5 497 aa11.36□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 SLC25A13Q9UJS0 675 aa11.36□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 VPS28Q9UK41 221 aa11.36□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 PILRBQ9UKJ0 227 aa11.36□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 OR51B4Q9Y5P0 310 aa11.36□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 SNX10Q9Y5X0 201 aa11.36□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 TTC34A8MYJ7 566 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 GDF9O60383 454 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 GZMAP12544 262 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 ITPKAP23677 461 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 RRM1P23921 792 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 ADRA1BP35368 520 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 STK19P49842 368 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 HDAC4P56524 1084 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 KRT83P78385 493 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 WDR45BQ5MNZ6 344 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 C9orf64Q5T6V5 341 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 TCEAL6Q6IPX3 200 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 DCUN1D2Q6PH85 259 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 LRSAM1Q6UWE0 723 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF783Q6ZMS7 281 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 DCAF4L2Q8NA75 395 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 OR52K2Q8NGK3 314 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 TCEAL3Q969E4 200 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 TRIM11Q96F44 468 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 CNPY3Q9BT09 278 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 EDEM2Q9BV94 578 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 ZYG11BQ9C0D3 744 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 MUC3BQ9H195 1237 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 OSBPL2Q9H1P3 480 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 PARVAQ9NVD7 372 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 TAS2R14Q9NYV8 317 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 IFNKQ9P0W0 207 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 OR12D3Q9UGF7 316 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 SUSD2Q9UGT4 822 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 LNP1A1A4G5 178 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 ILVBLA1L0T0 632 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 MEI4A8MW99 385 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 TMCO5BA8MYB1 307 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 CCP110O43303 1012 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 ATP9BO43861 1147 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 SRGAP2O75044 1071 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 ADH1BP00325 375 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 OR1E1P30953 314 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 AIF1P55008 147 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 ZBED6P86452 979 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 FOXK2Q01167 660 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 SCAPQ12770 1279 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 CST6Q15828 149 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 DUOXA1Q1HG43 343 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 RAB6CQ53S08 254 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 TRIM61Q5EBN2 209 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 ARTNQ5T4W7 220 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 STPG1Q5TH74 334 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 MANEALQ5VSG8 457 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 SLC23A3Q6PIS1 610 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 USP30Q70CQ3 517 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 DEFB119Q8N690 84 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 FRS2Q8WU20 508 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 PTPRN2Q92932 1015 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 GPR174Q9BXC1 333 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 BTBD1Q9H0C5 482 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 RAB6CQ9H0N0 254 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 TSPY26PQ9H489 355 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 MTG2Q9H4K7 406 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 SGK2Q9HBY8 427 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM74BQ9NUR3 256 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 MPP6Q9NZW5 540 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 CAPN11Q9UMQ6 739 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 HS3ST2Q9Y278 367 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa11.34□□□□□ -0.59
UBXN8-209ENST00000620074 DCHS1Q96JQ0 3298 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN8-209ENST00000620074 PATE3B3GLJ2 98 aa11.33□□□□□ -0.6
UBXN8-209ENST00000620074 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.61e-7■■■□□ 15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms