RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 WDTC1Q8N5D0 677 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 SLC2A13Q96QE2 648 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 KDM4CQ9H3R0 1056 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 BECN2A8MW95 431 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 CBX4O00257 560 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 C1SP09871 688 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 SLC45A4Q5BKX6 768 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 FBXL22Q6P050 247 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 DEFB106AQ8N104 65 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 ALG14Q96F25 216 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 DDIT4Q9NX09 232 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 SARDHQ9UL12 918 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 ASXL3Q9C0F0 2248 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 A0A087WV48 116 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 SLC7A4O43246 635 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 CDK4P11802 303 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 RXRGP48443 463 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJC3Q13217 504 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 GJB7Q6PEY0 223 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM65Q6PJ69 517 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 DSG4Q86SJ6 1040 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 EID2Q8N6I1 236 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 MFSD2AQ8NA29 543 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 LRIG1Q96JA1 1093 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 FAM81BQ96LP2 452 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R9BQ96SB3 815 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 CPXM1Q96SM3 734 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 FEM1AQ9BSK4 669 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 CRACR2AQ9BSW2 395 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 ASNSD1Q9NWL6 643 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 PLK4O00444 970 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 ATP9BO43861 1147 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 RTN2O75298 545 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 CENPCQ03188 943 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 AUHQ13825 339 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 EFHC1Q5JVL4 640 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 OXR1Q8N573 874 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 OR52K2Q8NGK3 314 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 OR8D1Q8WZ84 308 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 TSC1Q92574 1164 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 RNF34Q969K3 372 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 COX16Q9P0S2 106 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 HSF2BPO75031 334 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 RFPL3O75679 317 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 NUDT1P36639 197 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 ACADVLP49748 655 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 BNIP3Q12983 259 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 SFMBT2Q5VUG0 894 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 FAM46CQ5VWP2 391 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 IQCHQ86VS3 1027 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 PPM1HQ9ULR3 514 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 OR51B4Q9Y5P0 310 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 GRAP2O75791 330 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 JUPP14923 745 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 SLC9A1P19634 815 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 HNF1BP35680 557 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 USP8P40818 1118 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 IRAK1P51617 712 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN6P56747 220 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 MTA1Q13330 715 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 BECN1Q14457 450 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP44Q17R89 818 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 ACCSLQ4AC99 568 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 AGBL4Q5VU57 503 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 SHC3Q92529 594 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 APEX2Q9UBZ4 518 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 SLC25A13Q9UJS0 675 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 VANGL2Q9ULK5 521 aa25.63■■□□□ 1.69
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PTPRF-216ENST00000617451 DMTF1Q9Y222 760 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 BPTFQ12830 3046 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 MCF2LO15068 1137 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 ALOX15BO15296 676 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 APBA1Q02410 837 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 CNTN1Q12860 1018 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 OVGP1Q12889 678 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 DLG2Q15700 870 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM69Q86WT6 500 aa25.62■■□□□ 1.69
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