RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C5AR1	P21730	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANXA13	P27216	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KRT2	P35908	639 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRPH	P41219	470 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PHKA1	P46020	1223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZBED6	P86452	979 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DRP2	Q13474	957 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PNOC	Q13519	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MEA1	Q16626	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	P3H4	Q92791	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	WDR24	Q96S15	920 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CACNA1S	Q13698	1873 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FCHO1	O14526	889 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PSMA7	O14818	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FES	P07332	822 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FGFR2	P21802	821 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KIF5B	P33176	963 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KCNJ5	P48544	419 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CASP8	Q14790	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PARP10	Q53GL7	1025 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525		Q7L0L9	218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CROCCP2	Q86T23	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	USP37	Q86T82	979 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DEFB123	Q8N688	67 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CUL5	Q93034	780 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DHX58	Q96C10	678 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRIM17	Q9Y577	477 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SZT2	Q5T011	3432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms