RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	RGS18	Q9NS28	235 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232		H0YGN5	161 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PRRG1	O14668	218 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	NAT1	P18440	290 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ITIH2	P19823	946 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TYK2	P29597	1187 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	HDAC4	P56524	1084 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	RIPK1	Q13546	671 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	DPYSL3	Q14195	570 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	MFSD3	Q96ES6	412 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF778	Q96MU6	729 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	NDN	Q99608	321 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	DSE	Q9UL01	958 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	NFS1	Q9Y697	457 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232		C9JVG2	144 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	RNF103	O00237	685 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	GABRD	O14764	452 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	EOMES	O95936	686 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	OR1D2	P34982	312 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF366	Q8N895	744 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	KLC2	Q9H0B6	622 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PHF24	Q9UPV7	400 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CBX4	O00257	560 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	COPE	O14579	308 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	BAG2	O95816	211 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ALDH2	P05091	517 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TLE2	Q04725	743 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM26D	Q5JW98	314 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PLD5	Q8N7P1	536 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ERP27	Q96DN0	273 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SMO	Q99835	787 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A1B0GVG6	124 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	NBN	O60934	754 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	MATK	P42679	507 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	EPHB1	P54762	984 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TWF1	Q12792	350 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CFAP157	Q5JU67	520 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	BBS12	Q6ZW61	710 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CHSY1	Q86X52	802 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	BBOF1	Q8ND07	529 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ESAM	Q96AP7	390 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	UROC1	Q96N76	676 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	HAO1	Q9UJM8	370 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TET1	Q8NFU7	2136 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ENPP3	O14638	875 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	KRT16	P08779	473 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TUB	P50607	506 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	NCALD	P61601	193 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PTK6	Q13882	451 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TEKT4	Q8WW24	435 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CPT1B	Q92523	772 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	FBXO32	Q969P5	355 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	RNF157	Q96PX1	679 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	AGAP2	Q99490	1192 aa		10.04	□□□□□ -0.8

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