RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF510Q9Y2H8 683 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 K7EQS6 105 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 MSI1O43347 362 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 MOCS3O95396 460 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 SERPINF2P08697 491 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 ITPKAP23677 461 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 HARS2P49590 506 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 USP4Q13107 963 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 SLFN11Q7Z7L1 901 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC33Q8N5R6 958 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC57Q8N9N7 239 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF34Q969K3 372 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 WDCPQ9H6R7 721 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 HELZP42694 1942 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 GRID2IPA4D2P6 1211 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 KALRNO60229 2985 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 PRPSAP2O60256 369 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF5CO60282 957 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 STC2O76061 302 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 IFNAR2P48551 515 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 SEC13P55735 322 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 EML3Q32P44 896 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC38Q5VT99 294 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 MINDY1Q8N5J2 469 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 FRMD1Q8N878 549 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 CAPN10Q9HC96 672 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 FSCN3Q9NQT6 498 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 SMPD4Q9NXE4 827 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 ALG6Q9Y672 507 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 E2F8A0AVK6 867 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 LEFTY2O00292 366 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 SPOPO43791 374 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 PALMO75781 387 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 FTH1P19P0C7X4 201 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 MIPP30301 263 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC14A1Q13336 389 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 BOLA3Q53S33 107 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM92Q6UXU6 159 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 HTR3DQ70Z44 454 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 POLNQ7Z5Q5 900 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 RABEPKQ7Z6M1 372 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 SH3RF2Q8TEC5 729 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 BTN2A3PQ96KV6 586 aa24.35■■□□□ 1.49
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CAPNS1-214ENST00000592483 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 DKK4Q9UBT3 224 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 WNT6Q9Y6F9 365 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT7P08729 469 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 COMTP21964 271 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC11A2P49281 568 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF77Q15935 545 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP7D1Q3KQU3 841 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 SCYL2Q6P3W7 929 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM131BQ86XD5 332 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 PNPLA1Q8N8W4 532 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 TEKT4Q8WW24 435 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 HAPLN3Q96S86 360 aa24.34■■□□□ 1.49
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CAPNS1-214ENST00000592483 USP27XA6NNY8 438 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP33O14559 1287 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
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CAPNS1-214ENST00000592483 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
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CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 RHOT1Q8IXI2 618 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 OTUB2Q96DC9 234 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 CAMK1GQ96NX5 476 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 TKTL2Q9H0I9 626 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 TBC1D14Q9P2M4 693 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 STOML2Q9UJZ1 356 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 AMFRQ9UKV5 643 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-214ENST00000592483 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-214ENST00000592483 SH3BP5O60239 455 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-214ENST00000592483 HMBSP08397 361 aa24.32■■□□□ 1.48
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