RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592159.1

KDM4B-209, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 3

Gene KDM4B, Length 411 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-209ENST00000592159 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 K7ESF4 209 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 MCF2LO15068 1137 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 PAGE1O75459 146 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ERLIN1O75477 346 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 GAS8O95995 478 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 APOC2P02655 101 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 SLC2A3P11169 496 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 TGM2P21980 687 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 GABRR2P28476 465 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 GGCXP38435 758 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ATP5OP48047 213 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 SCAPQ12770 1279 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.812e-6■■■□□ 14.9
KDM4B-209ENST00000592159 BRD3Q15059 726 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 CCDC6Q16204 474 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 FAM72AQ5TYM5 149 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 FAM72DQ6L9T8 149 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 Q6ZS52 159 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 WDR5BQ86VZ2 330 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 FAM72BQ86X60 149 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 VSIG1Q86XK7 387 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 SYNPOQ8N3V7 929 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 PLD5Q8N7P1 536 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ANKRD7Q92527 254 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 PSMG2Q969U7 264 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 RSPRY1Q96DX4 576 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 MYRFLQ96LU7 910 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 C10orf88Q9H8K7 445 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 TRPC7Q9HCX4 862 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 TMEM51Q9NW97 253 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 GTSE1Q9NYZ3 720 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 OR12D3Q9UGF7 316 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 GREB1Q4ZG55 1949 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ZNF487B1APH4 448 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 I6L893 689 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 SGK1O00141 431 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ARNTLO00327 626 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ATG13O75143 517 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 MAP3K6O95382 1288 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 CTHP32929 405 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 PPP3CCP48454 512 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 CARSP49589 748 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 VPS41P49754 854 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 FCHO2Q0JRZ9 810 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 NOMO1Q15155 1222 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 TRADDQ15628 312 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 SLC9A4Q6AI14 798 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 WDR93Q6P2C0 686 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 RFX8Q6ZV50 586 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 CCDC33Q8N5R6 958 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 BPIFB1Q8TDL5 484 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 FAF2Q96CS3 445 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 GCNAQ96QF7 691 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 HAPLN3Q96S86 360 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ERP44Q9BS26 406 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 LRRC3Q9BY71 257 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 OSBPL2Q9H1P3 480 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 GDF3Q9NR23 364 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ARHGEF4Q9NR80 690 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 GKN1Q9NS71 199 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ETNK2Q9NVF9 386 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 ASIC3Q9UHC3 531 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 RAB21Q9UL25 225 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 SNX24Q9Y343 169 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa9.98□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 C2orf78A6NCI8 922 aa9.97□□□□□ -0.81
KDM4B-209ENST00000592159 KCNU1A8MYU2 1149 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.6 ms