RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SATB1Q01826 763 aa33.95■■■■□ 3.03
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TSC1Q92574 1164 aa33.95■■■■□ 3.03
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR7D4Q8NG98 312 aa33.94■■■■□ 3.02
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC57Q8N9N7 239 aa33.93■■■■□ 3.02
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP13A1Q9HD20 1204 aa33.93■■■■□ 3.02
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CTDNEP1-209ENST00000574205 IL4RP24394 825 aa33.92■■■■□ 3.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 WASP42768 502 aa33.92■■■■□ 3.02
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NUP205Q92621 2012 aa33.91■■■■□ 3.02
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PARP15Q460N3 678 aa33.9■■■■□ 3.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYCE1Q8N0S2 351 aa33.9■■■■□ 3.02
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PALMO75781 387 aa33.89■■■■□ 3.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRKCHP24723 683 aa33.89■■■■□ 3.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 ODF2Q5BJF6 829 aa33.89■■■■□ 3.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMCO3Q6UWJ1 677 aa33.89■■■■□ 3.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAMKK1Q8N5S9 505 aa33.89■■■■□ 3.02
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KLC2Q9H0B6 622 aa33.89■■■■□ 3.02
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