RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565442.1

CHD9-215, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 9, human

TSL 2

Gene CHD9, Length 703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD9-215	ENST00000565442	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	MAF1	Q9H063	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	PLAU	P00749	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	CYP4B1	P13584	511 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	TNNT1	P13805	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	ARSA	P15289	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	PGM1	P36871	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	SOX2	P48431	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	MVD	P53602	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	ADPRH	P54922	357 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	NR1H2	P55055	460 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	TDG	Q13569	410 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	IP6K1	Q92551	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	MROH8	Q9H579	483 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	INPPL1	O15357	1258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	METTL18	O95568	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	PRKCH	P24723	683 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	GSTM2	P28161	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	EPHB2	P29323	1055 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	TYK2	P29597	1187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	NFIL3	Q16649	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	KAT2B	Q92831	832 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	GALNT2	Q10471	571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	RALBP1	Q15311	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-215	ENST00000565442	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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