RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556339.5

ATXN3-240, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 525 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-240	ENST00000556339	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	NELL1	Q92832	810 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	S1PR5	Q9H228	398 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339		A0A087WWV3	80 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TBX3	O15119	743 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SPTLC2	O15270	562 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SLC37A4	O43826	429 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	DTNB	O60941	627 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	LY86	O95711	162 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	UROD	P06132	367 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CTSA	P10619	480 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SKIL	P12757	684 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	EPCAM	P16422	314 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	AXL	P30530	894 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CXCR5	P32302	372 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ME1	P48163	572 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MGAT5	Q09328	741 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PPP2R5C	Q13362	524 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	EMC2	Q15006	297 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CAMK4	Q16566	473 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ANO5	Q75V66	913 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	C4orf19	Q8IY42	314 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SUSD6	Q92537	303 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CPB2	Q96IY4	423 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	C8orf76	Q96K31	380 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	LXN	Q9BS40	222 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	POMK	Q9H5K3	350 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	NID2	Q14112	1375 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TRIP11	Q15643	1979 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ARL5C	A6NH57	179 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	LEFTY2	O00292	366 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	EDIL3	O43854	480 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	JAK2	O60674	1132 aa		4.25	□□□□□ -1.73

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