RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 TMEM59LQ9UK28 342 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 A0A1B0GVT2 93 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 LRRC72A6NJI9 287 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 BNIP3LO60238 219 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 SRGAP2O75044 1071 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 C5AR1P21730 350 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 CD27P26842 260 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 NSFP46459 744 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 KRT83P78385 493 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
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PRKCH-216ENST00000555542 C5orf22Q49AR2 442 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 ALFQ53S48 1182 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 DSG4Q86SJ6 1040 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 FAM131BQ86XD5 332 aa25.12■■□□□ 1.61
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PRKCH-216ENST00000555542 FAM129BQ96TA1 746 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 FZD4Q9ULV1 537 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa25.12■■□□□ 1.61
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PRKCH-216ENST00000555542 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 E9PAM4 449 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 CD59P13987 128 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 CHRNB2P17787 502 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 MMP8P22894 467 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 SDC4P31431 198 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 GALCP54803 685 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 SHC2P98077 582 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 TRNP1Q6NT89 227 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 NCEH1Q6PIU2 408 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 ALG14Q96F25 216 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 C1orf74Q96LT6 269 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 TM9SF3Q9HD45 589 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 MPP6Q9NZW5 540 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 I6L893 689 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 GOT1P17174 413 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 OR1E1P30953 314 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 C6orf118Q5T5N4 469 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 ARCQ7LC44 396 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 AADATQ8N5Z0 425 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 OR2T34Q8NGX1 318 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 OR14C36Q8NHC7 312 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 C1orf216Q8TAB5 229 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 FRS2Q8WU20 508 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 HAPLN3Q96S86 360 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 TMEM63CQ9P1W3 806 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 OR51B4Q9Y5P0 310 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa25.1■■□□□ 1.61
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PRKCH-216ENST00000555542 ARL13BQ3SXY8 428 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 FAM46CQ5VWP2 391 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 Q6ZVU0 165 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 NAXDQ8IW45 347 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 ATP11CQ8NB49 1132 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 RXFP2Q8WXD0 754 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 IL21RQ9HBE5 538 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 ADAM22Q9P0K1 906 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 DRGXA6NNA5 263 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 ATP9BO43861 1147 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 IGHV4-34P06331 123 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 VASPP50552 380 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 LAYNQ6UX15 382 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF683Q8IZ20 524 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 SH2D3CQ8N5H7 860 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 CCDC114Q96M63 670 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 CAMK1GQ96NX5 476 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 SELENOOQ9BVL4 669 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 ZYG11BQ9C0D3 744 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 OSGEPQ9NPF4 335 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 TM7SF3Q9NS93 570 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 LRRC10BA6NIK2 292 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKCH-216ENST00000555542 SNAP91O60641 907 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKCH-216ENST00000555542 UNGP13051 313 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PRKCH-216ENST00000555542 ATP1A3P13637 1013 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKCH-216ENST00000555542 ADPRHP54922 357 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKCH-216ENST00000555542 C21orf59P57076 290 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKCH-216ENST00000555542 BNC1Q01954 994 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKCH-216ENST00000555542 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa25.07■■□□□ 1.6
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