RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	HSFY1	Q96LI6	401 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SERPINB11	Q96P15	392 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	FAM129B	Q96TA1	746 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	STIM2	Q9P246	746 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TTC34	A8MYJ7	566 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TULP2	O00295	520 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688		O00370	1275 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	MT-CO3	P00414	261 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	IL1B	P01584	269 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	LTF	P02788	710 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PAEP	P09466	180 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	LCP1	P13796	627 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CD19	P15391	556 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SLC6A4	P31645	630 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	USP8	P40818	1118 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SGSH	P51688	502 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ADPRH	P54922	357 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TMPRSS3	P57727	454 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CXADR	P78310	365 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	BNIP3	Q12983	259 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CUL2	Q13617	745 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	IQCB1	Q15051	598 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PROX2	Q3B8N5	592 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PKDCC	Q504Y2	493 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	NEK5	Q6P3R8	708 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TRIM69	Q86WT6	500 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ERICH1	Q86X53	443 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PTPRN2	Q92932	1015 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	NT5C1B	Q96P26	610 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SPAG5	Q96R06	1193 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	LGMN	Q99538	433 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	NDST4	Q9H3R1	872 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	MTG2	Q9H4K7	406 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	USP29	Q9HBJ7	922 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ACP6	Q9NPH0	428 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CEP83	Q9Y592	693 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		7.07	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CKAP5	Q14008	2032 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SPEG	Q15772	3267 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	NEMP2	A6NFY4	417 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SMTNL1	A8MU46	457 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CBX4	O00257	560 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	WNT9A	O14904	365 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	EPHB6	O15197	1021 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ALOX15B	O15296	676 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TEX33	O43247	280 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	GP1BA	P07359	652 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	KRT5	P13647	590 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ZNF18	P17022	549 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28

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