RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	GPD2	P43304	727 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	PLA2G4A	P47712	749 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	ZBED6	P86452	979 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	TRIM14	Q14142	442 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	RAB41	Q5JT25	222 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	SCD5	Q86SK9	330 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	PIGZ	Q86VD9	579 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	ZNF677	Q86XU0	584 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	DENND1C	Q8IV53	801 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	CYLD	Q9NQC7	956 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	COMMD8	Q9NX08	183 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PR77	199 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	CAPN8	A6NHC0	703 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	GABBR2	O75899	941 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	MME	P08473	750 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	CCDC172	P0C7W6	258 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	KIF11	P52732	1056 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	GABRE	P78334	506 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	CDR2	Q01850	454 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	ARID5A	Q03989	594 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	VAC14	Q08AM6	782 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	INAVA	Q3KP66	663 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	PMF1	Q6P1K2	205 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	GANC	Q8TET4	914 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	UCMA	Q8WVF2	138 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	WBP1	Q96G27	269 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	TMEM245	Q9H330	911 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	USP3	Q9Y6I4	520 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PPC4	97 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	C1S	P09871	688 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	CKMT2	P17540	419 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	CHRNB2	P17787	502 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	HLA-F	P30511	346 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	CASP14	P31944	242 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	PRKCI	P41743	596 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	NUMB	P49757	651 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	SGSH	P51688	502 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	GALC	P54803	685 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	BROX	Q5VW32	411 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	TAF3	Q5VWG9	929 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	PASD1	Q8IV76	773 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	STK32A	Q8WU08	396 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	HSFY1	Q96LI6	401 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	SYT11	Q9BT88	431 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222	SCML2	Q9UQR0	700 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PP55	124 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SIGLEC6	O43699	453 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	USP12	O75317	370 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	DNTT	P04053	509 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	TKTL1	P51854	596 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	FMO1	Q01740	532 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	EFEMP1	Q12805	493 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ARID5B	Q14865	1188 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ASIC2	Q16515	512 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	PROX2	Q3B8N5	592 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CHST9	Q7L1S5	443 aa		14.27	□□□□□ -0.13

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