RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551634.5

NPAS3-211, Transcript of neuronal PAS domain protein 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene NPAS3, Length 2,718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3-211ENST00000551634 FBXO21O94952 628 aa24.11■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 CATSPER1Q8NEC5 780 aa24.11■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 FAM149B1Q96BN6 582 aa24.11■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 NPY6RQ99463 290 aa24.11■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 RBPJLQ9UBG7 517 aa24.11■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 TXNDC9O14530 226 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 DCLK1O15075 740 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 RPS6KA3P51812 740 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 FBXL19Q6PCT2 694 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 SLC2A14Q8TDB8 520 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 DRC3Q9H069 523 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 GPRC5DQ9NZD1 345 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 HCRTO43612 131 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 CYP2C9P11712 490 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 PTPN3P26045 913 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 NUDT2P50583 147 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 MPP3Q13368 585 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 Q3C1V9 767 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 DCAF6Q58WW2 860 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 TMC7Q7Z402 723 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 LCA5Q86VQ0 697 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 MCMBPQ9BTE3 642 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 SNX25Q9H3E2 840 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 STAP1Q9ULZ2 295 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa24.1■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 NCAM2O15394 837 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 CREB3O43889 395 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 RPL14P50914 215 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 FBXO47Q5MNV8 452 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 ARPINQ7Z6K5 226 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 DCUN1D1Q96GG9 259 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 AGAP3Q96P47 875 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 AGAP2Q99490 1192 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 MROH8Q9H579 483 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 GDAP2Q9NXN4 497 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 RAB26Q9ULW5 256 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 SLCO1B7G3V0H7 640 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 AIM2O14862 343 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 LMO2P25791 158 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 SERPINB5P36952 375 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 NPY2RP49146 381 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 IRF9Q00978 393 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 SEL1L3Q68CR1 1132 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 KCTD11Q693B1 232 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 DNAAF3Q8N9W5 541 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 NETO2Q8NC67 525 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 PPTC7Q8NI37 304 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 SETD4Q9NVD3 440 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 VTI1BQ9UEU0 232 aa24.09■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 CAPN8A6NHC0 703 aa24.08■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 HERC3Q15034 1050 aa24.08■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa24.08■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 LIPMQ5VYY2 423 aa24.08■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 ZYG11AQ6WRX3 759 aa24.08■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 SNX32Q86XE0 403 aa24.08■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 DSELQ8IZU8 1212 aa24.08■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 GCNAQ96QF7 691 aa24.08■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 SLC9A7Q96T83 725 aa24.08■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 BRD8Q9H0E9 1235 aa24.08■■□□□ 1.45
NPAS3-211ENST00000551634 KCNK1O00180 336 aa24.08■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 PIRO00625 290 aa24.08■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 MTSS1O43312 755 aa24.08■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 CSRP3P50461 194 aa24.08■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 AIF1P55008 147 aa24.08■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 ALKAL1Q6UXT8 129 aa24.08■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 PIGZQ86VD9 579 aa24.08■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 CAB39LQ9H9S4 337 aa24.08■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa24.08■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 CABYRO75952 493 aa24.07■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 CD4P01730 458 aa24.07■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 LTFP02788 710 aa24.07■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 ADIGQ0VDE8 80 aa24.07■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 PRKAA1Q13131 559 aa24.07■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 DLG2Q15700 870 aa24.07■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 PIGGQ5H8A4 983 aa24.07■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 KCNMB4Q86W47 210 aa24.07■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 VPS39Q96JC1 886 aa24.07■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 TNIP3Q96KP6 325 aa24.07■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 CXCL11O14625 94 aa24.07■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 ATP9BO43861 1147 aa24.07■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 CYP2B6P20813 491 aa24.07■■□□□ 1.44
NPAS3-211ENST00000551634 TLR1Q15399 786 aa24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms