RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 FAM84AQ96KN4 292 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 PKMYT1Q99640 499 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 MFRPQ9BY79 579 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 STRADBQ9C0K7 418 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 RNF38Q9H0F5 515 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 DLL4Q9NR61 685 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 GDAP2Q9NXN4 497 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 NLGN3Q9NZ94 848 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 FOXJ2Q9P0K8 574 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 CFAP97Q9P2B7 532 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 KCND3Q9UK17 655 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 L1RE1Q9UN81 338 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 CPQQ9Y646 472 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 BICDL2A1A5D9 508 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 CPED1A4D0V7 1026 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 NEMP2A6NFY4 417 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 BIN1O00499 593 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 IKBKBO14920 756 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 CACNG3O60359 315 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 HUS1O60921 280 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 MBD3O95983 291 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 EPB41P11171 864 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 KRT13P13646 458 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 COX6B1P14854 86 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 CYP2F1P24903 491 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 PCSK1P29120 753 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 ATICP31939 592 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 MAGEA11P43364 429 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 LHX1P48742 406 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 VAMP7P51809 220 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 DLG4P78352 724 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 MYL7Q01449 175 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 ZBTB16Q05516 673 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 PAK1Q13153 545 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 SPIDRQ14159 915 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 DDR2Q16832 855 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 DEFB109BQ30KR1 87 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 C1orf220Q5T0J3 134 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 SDHAF4Q5VUM1 108 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 ANKRD40Q6AI12 368 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 TTI2Q6NXR4 508 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 DPH6Q7L8W6 267 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 NAGSQ8N159 534 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 NELFBQ8WX92 580 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 ARSGQ96EG1 525 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 SERAC1Q96JX3 654 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 CEP295NLQ96MC4 621 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 CEP63Q96MT8 703 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 B3GNT4Q9C0J1 378 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 CDH19Q9H159 772 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 EPB41L5Q9HCM4 733 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 RRN3Q9NYV6 651 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 SCN8AQ9UQD0 1980 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 C9orf172C9J069 976 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 STMND1H3BQB6 276 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 GABRDO14764 452 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 OLFM2O95897 454 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 FAM163BP0C2L3 166 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 CISD3P0C7P0 127 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 GTF2H1P32780 548 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 DGKGP49619 791 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 CDH8P55286 799 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 CDC20Q12834 499 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 OVGP1Q12889 678 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 BIRC3Q13489 604 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 TRPC3Q13507 836 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 ART3Q13508 389 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 FGL2Q14314 439 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 E2F5Q15329 346 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 NR6A1Q15406 480 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 CDKN3Q16667 212 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-225ENST00000551253 ZACNQ401N2 412 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms