RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549306.1

HECTD4-210, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD4-210	ENST00000549306	ITGB8	P26012	769 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-210	ENST00000549306	CHRNA5	P30532	468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-210	ENST00000549306	TNFSF8	P32971	234 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-210	ENST00000549306	TAF6	P49848	677 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-210	ENST00000549306	TUBA1B	P68363	451 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-210	ENST00000549306	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-210	ENST00000549306	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-210	ENST00000549306	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-210	ENST00000549306	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-210	ENST00000549306	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-210	ENST00000549306	IP6K1	Q92551	441 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-210	ENST00000549306	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-210	ENST00000549306	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-210	ENST00000549306	PKP4	Q99569	1192 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-210	ENST00000549306	EPYC	Q99645	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-210	ENST00000549306	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-210	ENST00000549306	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-210	ENST00000549306	KIAA0556	O60303	1618 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	TIAM1	Q13009	1591 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	STMND1	H3BQB6	276 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	KCNJ13	O60928	360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	FAR2	Q96K12	515 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	DISP1	Q96F81	1524 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	ZBED1	O96006	694 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	IDE	P14735	1019 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	TRAF3	Q13114	568 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	IL25	Q9H293	177 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	SHROOM2	Q13796	1616 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	TPP1	O14773	563 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	DAO	P14920	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	AMT	P48728	403 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	NUDT6	P53370	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	DAG1	Q14118	895 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	HNF4G	Q14541	408 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	HECW1	Q76N89	1606 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	CHD1	O14646	1710 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	MYL4	P12829	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	GM2A	P17900	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	STAT1	P42224	750 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	VEGFC	P49767	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	DPP10	Q8N608	796 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	SNX27	Q96L92	541 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	IGFBP2	P18065	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	CSHL1	Q14406	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	PHKB	Q93100	1093 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-210	ENST00000549306	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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