RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM92Q6UXU6 159 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 MDM1Q8TC05 714 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 CAPN10Q9HC96 672 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 MED4Q9NPJ6 270 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 FSCN3Q9NQT6 498 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 CEP192Q8TEP8 1941 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDH15Q96QU1 1955 aa20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 TJP3O95049 919 aa20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 DESP17661 470 aa20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF77Q15935 545 aa20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 WSCD1Q658N2 575 aa20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 RABEPKQ7Z6M1 372 aa20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 FRMD1Q8N878 549 aa20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 WNT6Q9Y6F9 365 aa20.6■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 DAPK3O43293 454 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 ECEL1O95672 775 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 CYP11A1P05108 521 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 FTH1P19P0C7X4 201 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 TCF4P15884 667 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 CDR1P51861 262 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC8A3P57103 927 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC14A1Q13336 389 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 MAP7D1Q3KQU3 841 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 ODF2Q5BJF6 829 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 EMC1Q8N766 993 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 ATL2Q8NHH9 583 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 RXFP2Q8WXD0 754 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 LRRC45Q96CN5 670 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 DUSP16Q9BY84 665 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 CDH9Q9ULB4 789 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 MAST4O15021 2626 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 TULP2O00295 520 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGAP33O14559 1287 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 GABBR2O75899 941 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC130P13994 396 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 PDGFRAP16234 1089 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 CDKN2BP42772 138 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 PTPN9P43378 593 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 RGS7P49802 495 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 USP4Q13107 963 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 TRADDQ15628 312 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 VSIG1Q86XK7 387 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 FUKQ8N0W3 1084 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 DKK4Q9UBT3 224 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 DSEQ9UL01 958 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDSP2-204ENST00000548823 ANTXRLA6NF34 631 aa20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 HCRTO43612 131 aa20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 SH3BP5O60239 455 aa20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 ENDOD1O94919 500 aa20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM153BP0C7A2 387 aa20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 PCSK1P29120 753 aa20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 ADORA2BP29275 332 aa20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 MIPP30301 263 aa20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 OPRD1P41143 372 aa20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM153CQ494X1 144 aa20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 TEKT4Q8WW24 435 aa20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM153AQ9UHL3 310 aa20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 PTPRBP23467 1997 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 GAS8O95995 478 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 USP17L7P0C7H9 530 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 CSH1P0DML2 217 aa20.57■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 CSH2P0DML3 217 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms