RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 FAM72CH0Y354 149 aa22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 SERPING1P05155 500 aa22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 ITPKAP23677 461 aa22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 OR1E1P30953 314 aa22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 ZNF33AQ06730 810 aa22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 FAM72AQ5TYM5 149 aa22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 FAM72DQ6L9T8 149 aa22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 SLFN11Q7Z7L1 901 aa22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 FAM124AQ86V42 546 aa22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 FAM72BQ86X60 149 aa22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 PTPRN2Q92932 1015 aa22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 ZNF653Q96CK0 615 aa22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 PSMB7Q99436 277 aa22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 GDF9O60383 454 aa22.43■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 DESP17661 470 aa22.43■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 VASPP50552 380 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 KRT83P78385 493 aa22.43■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 ZBTB16Q05516 673 aa22.43■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 SCAPQ12770 1279 aa22.43■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 TMC6Q7Z403 805 aa22.43■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 SYT12Q8IV01 421 aa22.43■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 HSPA12BQ96MM6 686 aa22.43■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 GPR174Q9BXC1 333 aa22.43■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 ISCUQ9H1K1 167 aa22.43■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 TMEM74BQ9NUR3 256 aa22.43■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.43■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 A0A0D9SEW6 157 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 TMEM191CA6NGB0 347 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 PATE3B3GLJ2 98 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 SNAP91O60641 907 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 LRIG2O94898 1065 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 DNTTP04053 509 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 VAV1P15498 845 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 PSMA2P25787 234 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 DPP6P42658 865 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 VPS36Q86VN1 386 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 DRC7Q8IY82 874 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 STK40Q8N2I9 435 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 DCAF4L2Q8NA75 395 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 NETO1Q8TDF5 533 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 FRS2Q8WU20 508 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 TRIM11Q96F44 468 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 FAM129BQ96TA1 746 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 RXFP3Q9NSD7 469 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 VPS51Q9UID3 782 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 PILRBQ9UKJ0 227 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 FZD10Q9ULW2 581 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 CFAP54Q96N23 3096 aa22.42■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 ILVBLA1L0T0 632 aa22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 ATP9BO43861 1147 aa22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 MYBL1P10243 752 aa22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 ACCSLQ4AC99 568 aa22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 EFHC2Q5JST6 749 aa22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 ZNF783Q6ZMS7 281 aa22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 PYROXD2Q8N2H3 581 aa22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 OR7D4Q8NG98 312 aa22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 FOXJ1Q92949 421 aa22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 TRIM7Q9C029 511 aa22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 DLL3Q9NYJ7 618 aa22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 NEU3Q9UQ49 428 aa22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 SCINQ9Y6U3 715 aa22.41■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 RHOQP17081 205 aa22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 SDHBP21912 280 aa22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 GNA12Q03113 381 aa22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 DLG2Q15700 870 aa22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 CST6Q15828 149 aa22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 NLRP14Q86W24 1093 aa22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 VSTM4Q8IW00 320 aa22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 CADM4Q8NFZ8 388 aa22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 SPON2Q9BUD6 331 aa22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 SCML1Q9UN30 329 aa22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 HS3ST2Q9Y278 367 aa22.4■■□□□ 1.18
PUS1-211ENST00000544662 GON4LQ3T8J9 2241 aa22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms