RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541102.1

LTBR-209, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LTBR, Length 1,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-209ENST00000541102 CYP1A2P05177 515 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 PDGFRAP16234 1089 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 OXTRP30559 389 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 CXCR3P49682 368 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 IRAK1P51617 712 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 LIMK1P53667 647 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 ATP11AP98196 1134 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 SLC25A52Q3SY17 297 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 TKTL2Q9H0I9 626 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 RCCD1A6NED2 376 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 TMEM191CA6NGB0 347 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 TTC34A8MYJ7 566 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 F9P00740 461 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 MAOBP27338 520 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 DPP6P42658 865 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 RPS14P62263 151 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 ECT2LQ008S8 904 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 MTA1Q13330 715 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 ARCQ7LC44 396 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 CPNE8Q86YQ8 564 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 BTBD6Q96KE9 485 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 MRGPRX3Q96LB0 322 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 FSCN3Q9NQT6 498 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 PI4KAP42356 2102 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 CKAP5Q14008 2032 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 CEP192Q8TEP8 1941 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 A0A0U1RQJ8 604 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 A0A1B0GVM2 712 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 ANKRD62A6NC57 917 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 TCAF2A6NFQ2 919 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 MEI4A8MW99 385 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 CCP110O43303 1012 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 SIN3BO75182 1162 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 LCA5LO95447 670 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 DNTTP04053 509 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 MAPK8P45983 427 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 CDO1Q16878 200 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 DUOXA1Q1HG43 343 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 PPM1JQ5JR12 505 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 BRMS1LQ5PSV4 323 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 SYCP2LQ5T4T6 812 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 ARTNQ5T4W7 220 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 GANCQ8TET4 914 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 FOXJ1Q92949 421 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 MYO19Q96H55 970 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 TMEM9BQ9NQ34 198 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 PARVAQ9NVD7 372 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 SLC6A14Q9UN76 642 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 CNTN5O94779 1100 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 ENDOD1O94919 500 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 NDUFA10O95299 355 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 H2AFZP0C0S5 128 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 MYBL1P10243 752 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 ENGP17813 658 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 GPD1P21695 349 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 NNMTP40261 264 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 PTPN9P43378 593 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 OXCT1P55809 520 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 HDAC4P56524 1084 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 SLC12A1Q13621 1099 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 SLC23A3Q6PIS1 610 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 LRRC31Q6UY01 552 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 H2AFVQ71UI9 128 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-209ENST00000541102 FAM131BQ86XD5 332 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms